More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2558 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 296 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 		 282 aa  285  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.88 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.55 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 		 290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.1 
 
 		 276 aa  241  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.52 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.52 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.52 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.86 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.78 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.13 
 
 		 282 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 		 293 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 		 293 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  45.11 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  44.85 
 
 		 286 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  43.16 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  42.38 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  42.65 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 		 287 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 		 272 aa  198  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  41.79 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 		 284 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 277 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  42.24 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  38.93 
 
 		 283 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  39.93 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 286 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 303 aa  188  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  40.29 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  41.61 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  41.52 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  41.16 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.53 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 		 279 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 279 aa  179  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 286 aa  179  7e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 		 276 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  39.42 
 
 		 282 aa  176  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 		 274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  39.49 
 
 		 278 aa  171  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.13 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 		 285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 277 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>