More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2267 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 		 418 aa  852    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.93 
 
 		 441 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.17 
 
 		 442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.59 
 
 		 411 aa  571  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  65.78 
 
 		 421 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.59 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.96 
 
 		 419 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  61.15 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  62.83 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  60.43 
 
 		 421 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.41 
 
 		 434 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.02 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  59.86 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  57.35 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.66 
 
 		 435 aa  491  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.66 
 
 		 443 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.38 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.08 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.9 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.07 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.59 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.09 
 
 		 421 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  53.24 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.53 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  55.45 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.78 
 
 		 412 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.12 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.19 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.83 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.15 
 
 		 429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.15 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.19 
 
 		 451 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.59 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  55.26 
 
 		 408 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.59 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  53.32 
 
 		 414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.55 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.39 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.86 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.84 
 
 		 404 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.57 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.95 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  52.21 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.21 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.4 
 
 		 413 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  51.44 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  51.77 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.98 
 
 		 412 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.34 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  51.82 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.94 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.98 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.76 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.75 
 
 		 406 aa  430  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  50.12 
 
 		 423 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.36 
 
 		 414 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.47 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  49.04 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  48.54 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.2 
 
 		 425 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.09 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.68 
 
 		 414 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.15 
 
 		 414 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.34 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.18 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.77 
 
 		 414 aa  425  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.64 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.62 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  52.93 
 
 		 414 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.07 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.32 
 
 		 413 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 		 415 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.3 
 
 		 415 aa  423  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.92 
 
 		 414 aa  421  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  48.91 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.22 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  50 
 
 		 410 aa  421  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  51.95 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  50.36 
 
 		 413 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  49.88 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.73 
 
 		 413 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.76 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.54 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  48.91 
 
 		 420 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 		 414 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  49.27 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  50.61 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.02 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.22 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.78 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  49.27 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  52.44 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  49.88 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.86 
 
 		 413 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.63 
 
 		 419 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.65 
 
 		 408 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  47.82 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.71 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  49.27 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>