61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2198 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  794    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  38.1 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  37.08 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  36.27 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  35.8 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  36.31 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  37.5 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  37.5 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  37.5 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  41.09 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  37.82 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  38.96 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  38.1 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  34.84 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  37.47 
 
 		 398 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  35.08 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  36.08 
 
 		 417 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  36.08 
 
 		 417 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  40.14 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  31.82 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  33.55 
 
 		 469 aa  146  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  36.87 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  32.69 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  38.34 
 
 		 470 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  35.47 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  39.4 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  35.09 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  34.88 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  35.84 
 
 		 419 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  34.39 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  36.86 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  34.23 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  36.58 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  35.37 
 
 		 443 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  35.37 
 
 		 443 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  34.56 
 
 		 477 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  35.37 
 
 		 443 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  33.44 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  34.86 
 
 		 477 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  34.19 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  32.8 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  32.8 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  32.8 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  34.17 
 
 		 410 aa  116  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  33.56 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  33.56 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  33.56 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  36.7 
 
 		 570 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  39.01 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  31.87 
 
 		 428 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  31.87 
 
 		 428 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  31.87 
 
 		 428 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  33.78 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  33.71 
 
 		 455 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  33.63 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  34.92 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  39.38 
 
 		 429 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  29.26 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.17 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  29.3 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  30.23 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>