More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1255 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  100 
 
 		 463 aa  906    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  43.95 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  41.04 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  44.5 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  51.58 
 
 		 416 aa  206  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.96 
 
 		 403 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  42.25 
 
 		 452 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.03 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  38.94 
 
 		 410 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  49.13 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.13 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 444 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.13 
 
 		 435 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  49.77 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  45.09 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  52.68 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  43.03 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  47.3 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  47.09 
 
 		 388 aa  190  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.43 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  46.58 
 
 		 429 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.5 
 
 		 586 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  50 
 
 		 434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  45.95 
 
 		 429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  54.21 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.98 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.28 
 
 		 405 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  36.39 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  43.89 
 
 		 489 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.87 
 
 		 415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  46.43 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  52.82 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  45.22 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  44.66 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  48.25 
 
 		 429 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 		 375 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  45.41 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 343 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  36.83 
 
 		 410 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.56 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.5 
 
 		 621 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  46.26 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  44.81 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  33.55 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  45.69 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  42.01 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.83 
 
 		 508 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.1 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 624 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  49.53 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 		 587 aa  147  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 		 570 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 465 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 326 aa  136  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  41.44 
 
 		 365 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  42.18 
 
 		 580 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  41.9 
 
 		 237 aa  129  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 		 594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 725 aa  123  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  35.26 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 576 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 565 aa  110  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  40.32 
 
 		 686 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  40.64 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 595 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  40.32 
 
 		 650 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 709 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  33.04 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  32.31 
 
 		 404 aa  99.8  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  36.45 
 
 		 687 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  35.98 
 
 		 373 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  32.04 
 
 		 689 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 748 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  37.17 
 
 		 664 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>