More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0676 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 119 aa  236  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  69.57 
 
 		 123 aa  167  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  65.22 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  63.55 
 
 		 120 aa  149  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  70 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  60.71 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 122 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  53.98 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  46.49 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  42.34 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  52.73 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  46.49 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  46.49 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  48.62 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  53.4 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  52.29 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  42.34 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  41.59 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  54.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  43.27 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  44.54 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  42.59 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1279  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00230471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  36 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  35 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  32.5 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  32.5 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  31.67 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  36.78 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1402  GntR family transcriptional regulator, putative  26.45 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  31.96 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  27.1 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4189  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  29.36 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>