More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1593 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  100 
 
 
655 aa  1316    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  49.01 
 
 
657 aa  636    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  48.01 
 
 
720 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  45.92 
 
 
649 aa  568  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  43.93 
 
 
649 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  45.59 
 
 
653 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  42.92 
 
 
650 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  45.23 
 
 
649 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  44.07 
 
 
648 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  44.09 
 
 
648 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  43.97 
 
 
648 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  44.12 
 
 
648 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  46.19 
 
 
648 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  43.97 
 
 
648 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  44.55 
 
 
648 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  44.55 
 
 
648 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  44.27 
 
 
648 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  42.51 
 
 
649 aa  504  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  43.94 
 
 
654 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  40.52 
 
 
662 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  40.62 
 
 
674 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  39.72 
 
 
659 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.94 
 
 
680 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  41.15 
 
 
661 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  41.15 
 
 
661 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  38.45 
 
 
652 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  39.18 
 
 
668 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  40.15 
 
 
661 aa  449  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  40.64 
 
 
660 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  38.57 
 
 
678 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  40.43 
 
 
659 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  39.02 
 
 
668 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  39.02 
 
 
668 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  39.02 
 
 
668 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  39.63 
 
 
660 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  40.12 
 
 
659 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  39.18 
 
 
663 aa  435  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  39.14 
 
 
667 aa  435  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  39.02 
 
 
670 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  39.18 
 
 
670 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  39.33 
 
 
663 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.33 
 
 
669 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  38.17 
 
 
656 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  39.49 
 
 
666 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  40.43 
 
 
659 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  39.33 
 
 
669 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.33 
 
 
669 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.33 
 
 
669 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.33 
 
 
669 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.33 
 
 
669 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  38.69 
 
 
667 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  38.53 
 
 
666 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.8 
 
 
654 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  39.78 
 
 
661 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  39.13 
 
 
664 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  39.49 
 
 
661 aa  415  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  40 
 
 
658 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  39.15 
 
 
661 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  38.88 
 
 
661 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  38.86 
 
 
665 aa  398  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  38.68 
 
 
655 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  43.74 
 
 
570 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.41 
 
 
579 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  39.04 
 
 
661 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.61 
 
 
572 aa  355  2e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  34.26 
 
 
672 aa  349  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.47 
 
 
697 aa  342  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  31.33 
 
 
674 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 
666 aa  335  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
664 aa  334  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  31.54 
 
 
658 aa  334  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  37.75 
 
 
574 aa  329  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  32.46 
 
 
666 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 
666 aa  326  7e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  33.23 
 
 
636 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.69 
 
 
578 aa  318  2e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
665 aa  317  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  33.98 
 
 
629 aa  316  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  35.03 
 
 
665 aa  316  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  36.07 
 
 
568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.51 
 
 
671 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
656 aa  311  2e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  37.68 
 
 
590 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  35.62 
 
 
624 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  34.99 
 
 
583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  31.76 
 
 
670 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  33.93 
 
 
569 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.28 
 
 
568 aa  306  7e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 
668 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  34.03 
 
 
540 aa  306  9.000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.41 
 
 
589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  35.23 
 
 
589 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  34.93 
 
 
589 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  35.23 
 
 
589 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  35.29 
 
 
589 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 
693 aa  302  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  30.78 
 
 
741 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  33.27 
 
 
604 aa  300  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  36.03 
 
 
642 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1092  sodium/hydrogen exchanger  36.03 
 
 
642 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>