More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0590 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0590  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  71.35 
 
 		 508 aa  279  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  69.61 
 
 		 185 aa  271  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3032  galactosyl transferase, capsular polysaccharide synthesis enzyme  75.69 
 
 		 182 aa  262  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3172  galactosyl transferase  74.73 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  63.54 
 
 		 182 aa  256  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1485  sugar transferase  74.59 
 
 		 182 aa  254  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00302801  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  62.98 
 
 		 182 aa  254  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2528  sugar transferase  71.82 
 
 		 184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1277  sugar transferase  65.03 
 
 		 183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470933 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.6 
 
 		 506 aa  251  6e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2640  putative capsule biosynthesis protein  67.03 
 
 		 184 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1843  galactosyl-transferase, putative  63.24 
 
 		 191 aa  244  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2877  sugar transferase  76.97 
 
 		 184 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2612  sugar transferase  69.23 
 
 		 186 aa  238  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00297652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1539  sugar transferase  61.88 
 
 		 183 aa  238  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0350538  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  49.12 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0745  sugar transferase  42.54 
 
 		 451 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  39.79 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  41.05 
 
 		 210 aa  137  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  40.98 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  48.91 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  48.91 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2247  capsular polysaccharide synthesis protein  43.6 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.436876  hitchhiker  0.00758225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  45.77 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1277  sugar transferase  42.96 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0679585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  37.77 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  44.37 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1263  sugar transferase  53.85 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  40.68 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.96 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  45.83 
 
 		 186 aa  121  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3481  sugar transferase  52.25 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0937708  normal  0.263675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  46.15 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3985  sugar transferase  40.85 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  34.68 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2523  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.25 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  46.85 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  40.28 
 
 		 466 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  41.55 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  44.29 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1752  sugar transferase  52.25 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.44 
 
 		 231 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  42.36 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2726  sugar transferase  45.99 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  44.29 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3299  sugar transferase  40.88 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1493  sugar transferase  41.56 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6006  sugar transferase  44.8 
 
 		 219 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4061  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.52 
 
 		 522 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  43.07 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  45.77 
 
 		 463 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5365  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  52.34 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1487  sugar transferase  36.93 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10743  putative undecaprenyl-phosphate glycosyl-1-phosphate transferase  38.46 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.5 
 
 		 456 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000104182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  38.37 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2747  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.89 
 
 		 459 aa  107  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0373385  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  39.31 
 
 		 365 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1846  glycosyl transferase domain-containing protein  38.19 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.57 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.57 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2344  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  47.48 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  37.57 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4921  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.67 
 
 		 459 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1433  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  44.06 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0290  sugar transferase  41.45 
 
 		 464 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1243  sugar transferase  36.26 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.191306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2099  sugar transferase  39.61 
 
 		 252 aa  106  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672919  hitchhiker  0.000893553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0586  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.32 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1934  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.93 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02342  glycosyl transferase transmembrane protein  49.53 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4005  sugar transferase  43.57 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0111  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.44 
 
 		 477 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.629672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.07 
 
 		 501 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3524  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.36 
 
 		 470 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000171122  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.29 
 
 		 472 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3034  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  50.47 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104666  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37.04 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0494  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.8 
 
 		 219 aa  104  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1414  sugar transferase  37.29 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1153  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  35.33 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000801839  hitchhiker  0.000000000000434208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  50 
 
 		 598 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.69 
 
 		 473 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.51 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  38.04 
 
 		 402 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0517  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  44.74 
 
 		 450 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00757954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2000  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.14 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  38.69 
 
 		 473 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3537  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  34.91 
 
 		 488 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.69 
 
 		 473 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3394  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.61 
 
 		 243 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5612  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.12 
 
 		 485 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0716  sugar transferase  39.26 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  36.73 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2400  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.33 
 
 		 484 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.56 
 
 		 454 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  43.05 
 
 		 458 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>