More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1277 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1277  sugar transferase  100 
 
 
186 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0679585  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3985  sugar transferase  73.66 
 
 
186 aa  289  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3481  sugar transferase  79.57 
 
 
186 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0937708  normal  0.263675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  72.04 
 
 
186 aa  279  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1263  sugar transferase  72.58 
 
 
186 aa  271  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  69.89 
 
 
186 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  69.35 
 
 
188 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  66.13 
 
 
186 aa  267  8e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  68.28 
 
 
186 aa  266  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  67.2 
 
 
188 aa  266  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  68.28 
 
 
186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  66.13 
 
 
196 aa  258  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6006  sugar transferase  69.35 
 
 
219 aa  257  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1752  sugar transferase  67.2 
 
 
186 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  54.84 
 
 
187 aa  214  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  45.95 
 
 
211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  43.85 
 
 
210 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  46.24 
 
 
185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  46.24 
 
 
185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  46.49 
 
 
211 aa  171  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1934  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  46.49 
 
 
199 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.54 
 
 
473 aa  151  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.47 
 
 
207 aa  150  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5447  exopolysaccharide production protein ExoY  53.85 
 
 
134 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.94 
 
 
204 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02342  glycosyl transferase transmembrane protein  48.66 
 
 
203 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  43.01 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.7 
 
 
201 aa  144  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2726  sugar transferase  42.16 
 
 
197 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2247  capsular polysaccharide synthesis protein  44 
 
 
188 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.436876  hitchhiker  0.00758225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0461  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.09 
 
 
466 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323165  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2483  sugar transferase  42.7 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2376  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40 
 
 
461 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1433  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  42.7 
 
 
194 aa  139  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2474  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.55 
 
 
461 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203147  normal  0.0545465 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0597  general glycosylation pathway protein  40.31 
 
 
200 aa  138  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.54 
 
 
207 aa  138  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.54 
 
 
457 aa  137  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3034  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.32 
 
 
197 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104666  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1141  general glycosylation pathway protein  40.1 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.987369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3389  sugar transferase  40.32 
 
 
204 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.251832  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.39 
 
 
477 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0272  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.47 
 
 
477 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1266  general glycosylation pathway protein  40.1 
 
 
200 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.08 
 
 
471 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1493  sugar transferase  40.36 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1843  galactosyl-transferase, putative  42.39 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  44.83 
 
 
189 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  41.4 
 
 
230 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.21 
 
 
219 aa  135  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4262  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.68 
 
 
206 aa  134  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1057  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  43.09 
 
 
465 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  40.22 
 
 
461 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.86 
 
 
464 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  48.39 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.67 
 
 
464 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0111  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.93 
 
 
477 aa  132  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.629672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0543  hypothetical protein  42.16 
 
 
460 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  48.39 
 
 
182 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.78 
 
 
464 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.35 
 
 
456 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000104182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  39.78 
 
 
464 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.78 
 
 
464 aa  131  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.78 
 
 
464 aa  131  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.78 
 
 
464 aa  131  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  39.78 
 
 
464 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.78 
 
 
464 aa  131  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  39.78 
 
 
464 aa  131  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3443  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.01 
 
 
471 aa  130  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649798  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.18 
 
 
346 aa  130  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  41.08 
 
 
460 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2459  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.09 
 
 
498 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.253971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.31 
 
 
491 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2689  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.7 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4388  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.47 
 
 
468 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.5 
 
 
457 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  40.86 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0590  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  42.96 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01394  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumD  43.85 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5254  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.86 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.08 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.08 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2852  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.46 
 
 
208 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4441  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.5 
 
 
594 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.796924  normal  0.559619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.93 
 
 
461 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02480  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  40.54 
 
 
484 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0746534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0574  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.18 
 
 
200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.2884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  40.54 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08350  glycosyl transferase possibly involved in lipopolysaccharide synthesis  38.3 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.163172  normal  0.229141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3394  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.46 
 
 
243 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1068  putative glycosyl transferase  39.47 
 
 
494 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  38.25 
 
 
469 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3691  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.54 
 
 
445 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0831  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  34.67 
 
 
474 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4005  sugar transferase  41.94 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0489  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  35.11 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90918  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2023  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.86 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  hitchhiker  0.0000000000460797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1664  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.46 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1034  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.89 
 
 
490 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0510  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.16 
 
 
475 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>