More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3172 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3172  galactosyl transferase  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2528  sugar transferase  94.02 
 
 
184 aa  330  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1485  sugar transferase  92.31 
 
 
182 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00302801  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3032  galactosyl transferase, capsular polysaccharide synthesis enzyme  84.62 
 
 
182 aa  302  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2877  sugar transferase  94.02 
 
 
184 aa  299  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  74.59 
 
 
508 aa  283  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0590  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  74.73 
 
 
188 aa  280  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  64.84 
 
 
182 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  69.78 
 
 
185 aa  264  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  64.29 
 
 
182 aa  262  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.67 
 
 
506 aa  262  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1277  sugar transferase  62.43 
 
 
183 aa  241  6e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470933 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2640  putative capsule biosynthesis protein  67.39 
 
 
184 aa  239  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2612  sugar transferase  73.51 
 
 
186 aa  232  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00297652  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1843  galactosyl-transferase, putative  61.08 
 
 
191 aa  226  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1539  sugar transferase  58.24 
 
 
183 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0350538  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0745  sugar transferase  48.33 
 
 
451 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  50.59 
 
 
189 aa  164  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  40.98 
 
 
211 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  41.94 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  52.48 
 
 
185 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  52.48 
 
 
185 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  44.72 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1493  sugar transferase  44.08 
 
 
200 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2247  capsular polysaccharide synthesis protein  39.53 
 
 
188 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.436876  hitchhiker  0.00758225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  37.91 
 
 
186 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  37.71 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.05 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  39.56 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3985  sugar transferase  45.07 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  45.14 
 
 
188 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  43.66 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  45.77 
 
 
186 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  40.22 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.04 
 
 
207 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3481  sugar transferase  50.45 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0937708  normal  0.263675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1277  sugar transferase  36.07 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0679585  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3821  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.38 
 
 
206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1263  sugar transferase  48.72 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.12 
 
 
501 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6006  sugar transferase  46.4 
 
 
219 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  36.26 
 
 
186 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  35.56 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1752  sugar transferase  43.84 
 
 
186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0466  capsular polysaccharide biosynthesis protein  47.33 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000106234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  39.36 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  39.36 
 
 
194 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40 
 
 
204 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0631  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.48 
 
 
234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  38.98 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5883  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.56 
 
 
482 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.19 
 
 
201 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.46 
 
 
207 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  43.36 
 
 
358 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.58 
 
 
231 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0584  glycosyltransferase  44.97 
 
 
209 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000164965  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  42.66 
 
 
329 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10743  putative undecaprenyl-phosphate glycosyl-1-phosphate transferase  43.7 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.36 
 
 
346 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4237  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  32.31 
 
 
246 aa  108  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.952439  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2223  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  43.45 
 
 
458 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  36.07 
 
 
466 aa  107  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3064  sugar transferase  43.24 
 
 
490 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829905  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2744  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.71 
 
 
480 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000314973 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0890  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.76 
 
 
454 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.541362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  36.65 
 
 
461 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3367  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.71 
 
 
480 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0454  glycosyltransferase, putative  44.67 
 
 
222 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000102874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4820  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.79 
 
 
242 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.74 
 
 
491 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2523  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.65 
 
 
226 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0793  sugar transferase  37.24 
 
 
216 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.47 
 
 
212 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4955  sugar transferase; phospho-glucosyltransferase  42.76 
 
 
228 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.47 
 
 
212 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  39.47 
 
 
212 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2589  sugar transferase  34.04 
 
 
225 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1879  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.13 
 
 
314 aa  105  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.439269  hitchhiker  0.0000110821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1573  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  37.31 
 
 
470 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1414  sugar transferase  44.44 
 
 
198 aa  104  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1986  glycosyl transferase domain-containing protein  44.3 
 
 
402 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  39.47 
 
 
212 aa  104  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1951  sugar transferase  36.51 
 
 
472 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  0.0120821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  35.67 
 
 
243 aa  104  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3218  sugar transferase  39.13 
 
 
467 aa  104  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3920  sugar transferase  42.25 
 
 
199 aa  104  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00326653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1487  sugar transferase  40 
 
 
202 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5557  galactosyl transferase CpsE  38.5 
 
 
228 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000713124  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.29 
 
 
219 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4005  sugar transferase  42.76 
 
 
206 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0595  sugar transferase family protein  35.87 
 
 
220 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.750917  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1034  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.87 
 
 
490 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  38.15 
 
 
365 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2000  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.67 
 
 
215 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.84 
 
 
472 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0716  sugar transferase  42.22 
 
 
207 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4061  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.94 
 
 
522 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3055  sugar transferase  44.6 
 
 
185 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0289744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3938  sugar transferase  36.42 
 
 
245 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.28 
 
 
448 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>