More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0745 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0745  sugar transferase  100 
 
 		 451 aa  926    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  57.31 
 
 		 189 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  50 
 
 		 182 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  47.75 
 
 		 182 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1539  sugar transferase  45.6 
 
 		 183 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0350538  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2528  sugar transferase  50 
 
 		 184 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2640  putative capsule biosynthesis protein  53.06 
 
 		 184 aa  159  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1277  sugar transferase  48.31 
 
 		 183 aa  159  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2877  sugar transferase  53.02 
 
 		 184 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3172  galactosyl transferase  51.61 
 
 		 185 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.86 
 
 		 508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2612  sugar transferase  50.99 
 
 		 186 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00297652  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.35 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  47.19 
 
 		 185 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3032  galactosyl transferase, capsular polysaccharide synthesis enzyme  45.73 
 
 		 182 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1485  sugar transferase  47.1 
 
 		 182 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00302801  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0590  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  42.54 
 
 		 188 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1843  galactosyl-transferase, putative  50.34 
 
 		 191 aa  143  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  41.86 
 
 		 185 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  41.86 
 
 		 185 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2815  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.51 
 
 		 225 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  43.35 
 
 		 186 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  40.98 
 
 		 188 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.02 
 
 		 196 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  41.53 
 
 		 186 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  42.29 
 
 		 186 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  39.67 
 
 		 211 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1752  sugar transferase  46.94 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.07 
 
 		 219 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3064  sugar transferase  43.96 
 
 		 490 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  40.88 
 
 		 210 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3985  sugar transferase  40.8 
 
 		 186 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  41.34 
 
 		 188 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2070  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.38 
 
 		 247 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2852  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.62 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  41.71 
 
 		 186 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3191  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  31.94 
 
 		 220 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4955  sugar transferase; phospho-glucosyltransferase  39.02 
 
 		 228 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228905  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1277  sugar transferase  39.77 
 
 		 186 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0679585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2247  capsular polysaccharide synthesis protein  38.01 
 
 		 188 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.436876  hitchhiker  0.00758225 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1493  sugar transferase  40.76 
 
 		 200 aa  124  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0046  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.73 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1999  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  36.99 
 
 		 465 aa  123  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.267796  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0725  sugar transferase  39.64 
 
 		 221 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6399  sugar transferase  42.49 
 
 		 224 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1001  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.41 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.96 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  41.04 
 
 		 187 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6006  sugar transferase  40.57 
 
 		 219 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3055  sugar transferase  48.59 
 
 		 185 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0289744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  39.88 
 
 		 186 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1846  glycosyl transferase domain-containing protein  34.43 
 
 		 277 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325726  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3807  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  37 
 
 		 493 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.27586  normal  0.25829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1951  sugar transferase  40 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  0.0120821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3394  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.04 
 
 		 243 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2622  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.27 
 
 		 215 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1395  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.04 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2278  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.27 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1209  sugar transferase  37.63 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235052 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.88 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8603  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  44.97 
 
 		 488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  40.74 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1703  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.81 
 
 		 511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0935267  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3578  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.64 
 
 		 512 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3481  sugar transferase  43.54 
 
 		 186 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0937708  normal  0.263675 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2444  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.5 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2370  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.68 
 
 		 229 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.335038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1349  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.37 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000163511  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.64 
 
 		 498 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  39.27 
 
 		 214 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0831  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  36.79 
 
 		 474 aa  117  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1529  putative YVfC-like sugar transferase  46.36 
 
 		 226 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0595  sugar transferase family protein  32.86 
 
 		 220 aa  117  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.750917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2689  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  39.29 
 
 		 252 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22910  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.53 
 
 		 231 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0199  putative glycosyltransferase  40.44 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.954488  normal  0.493075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5883  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.59 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4356  sugar transferase  37.5 
 
 		 225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0975  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.07 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0624997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2414  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000120106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3176  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.25 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1263  sugar transferase  42.57 
 
 		 186 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2589  sugar transferase  32.69 
 
 		 225 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.18 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000104182  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1487  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  43.31 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2782  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.27 
 
 		 244 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1637  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.69 
 
 		 475 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3319  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.27 
 
 		 244 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.260704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3108  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  35.75 
 
 		 229 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5557  galactosyl transferase CpsE  36.1 
 
 		 228 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000713124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3137  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.95 
 
 		 506 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3542  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.31 
 
 		 473 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  35.68 
 
 		 230 aa  113  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2099  sugar transferase  39.06 
 
 		 252 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672919  hitchhiker  0.000893553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4832  sugar transferase  36.36 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0290406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  37.31 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2956  sugar transferase  36.41 
 
 		 242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1939  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.83 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4994  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.79 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2877  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.06 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>