48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02240 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  100 
 
 		 390 aa  807    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  74.81 
 
 		 392 aa  622  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  74.03 
 
 		 389 aa  577  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  64.6 
 
 		 386 aa  528  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  64.43 
 
 		 389 aa  509  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  36.61 
 
 		 334 aa  222  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  36.34 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  37.16 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  36.07 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  32.79 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  34.81 
 
 		 337 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  33.98 
 
 		 340 aa  196  9e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  35.52 
 
 		 342 aa  190  4e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  35.68 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  36.28 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  32.97 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  33.96 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  38.35 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  35.07 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  33.6 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  29.86 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  33.06 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  35.07 
 
 		 338 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  34.51 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  33.33 
 
 		 338 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  32.88 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  33.04 
 
 		 334 aa  177  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  31.03 
 
 		 337 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  33.62 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  33.24 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  32.25 
 
 		 351 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  32.55 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  33.7 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  26.17 
 
 		 211 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  26.58 
 
 		 215 aa  50.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  38.27 
 
 		 210 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  24.86 
 
 		 213 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  28.28 
 
 		 213 aa  47.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  32.65 
 
 		 205 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  26.9 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  24.66 
 
 		 208 aa  45.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  32.5 
 
 		 205 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1851  50S ribosomal protein L3  48.08 
 
 		 236 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722115 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 216 aa  44.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  28.23 
 
 		 212 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  23.02 
 
 		 211 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  27.06 
 
 		 219 aa  43.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 216 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>