42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH00790 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  100 
 
 		 590 aa  1188    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  34.65 
 
 		 880 aa  229  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  34.12 
 
 		 794 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.65 
 
 		 887 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  33.84 
 
 		 847 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  33.26 
 
 		 1017 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 		 846 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  34.37 
 
 		 990 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 		 1137 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 		 739 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.66 
 
 		 985 aa  190  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  32.48 
 
 		 1369 aa  189  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 		 730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  30.5 
 
 		 725 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 		 742 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  31.98 
 
 		 1759 aa  177  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  29.22 
 
 		 737 aa  176  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  29.62 
 
 		 563 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 		 736 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 		 707 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  29.06 
 
 		 715 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  28.3 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 		 710 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  28.11 
 
 		 686 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 611 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  25.9 
 
 		 757 aa  143  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 928 aa  143  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  27.54 
 
 		 984 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 894 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  27.13 
 
 		 789 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  25.44 
 
 		 778 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  25.04 
 
 		 949 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 		 961 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  24 
 
 		 854 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  24.71 
 
 		 2042 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  21.4 
 
 		 978 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  37.5 
 
 		 570 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  23.81 
 
 		 623 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  23.54 
 
 		 906 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  21.81 
 
 		 815 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  23.74 
 
 		 653 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  22.08 
 
 		 621 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>