244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1012 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0880  putative sodium transporter  97.76 
 
 
446 aa  796    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0426981  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1012  sodium transporter, putative  100 
 
 
446 aa  866    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0941  sodium transporter, putative  99.33 
 
 
446 aa  864    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  62.47 
 
 
444 aa  513  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0530  sodium- and chloride-dependent transporter  53.58 
 
 
445 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  51.69 
 
 
445 aa  423  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  49.66 
 
 
444 aa  422  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  51.25 
 
 
444 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  51.02 
 
 
444 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  50.79 
 
 
444 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  49.55 
 
 
448 aa  410  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0959  ModE family transcriptional regulator  47.52 
 
 
443 aa  397  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.167837  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1200  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  50.89 
 
 
450 aa  398  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.332542  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  47.64 
 
 
447 aa  394  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  46.82 
 
 
448 aa  392  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1504  sodium/neurotransmitter symporter family protein  47.75 
 
 
443 aa  395  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  47.3 
 
 
450 aa  386  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  47.02 
 
 
458 aa  385  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  35.98 
 
 
470 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  34.39 
 
 
453 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  36.05 
 
 
450 aa  256  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  36.51 
 
 
450 aa  256  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  37.08 
 
 
446 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  34.92 
 
 
452 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  36.02 
 
 
453 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  35.19 
 
 
452 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  36.85 
 
 
446 aa  249  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  36.63 
 
 
446 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  36.63 
 
 
446 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  36.85 
 
 
446 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  36.4 
 
 
446 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  36.63 
 
 
446 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  36.4 
 
 
446 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.4 
 
 
446 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 
454 aa  245  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.18 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  34.15 
 
 
461 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  35.83 
 
 
486 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.06 
 
 
446 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  34.01 
 
 
486 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  35.89 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  36 
 
 
461 aa  233  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
464 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  34.02 
 
 
452 aa  230  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  33.03 
 
 
476 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  31.97 
 
 
446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  35.83 
 
 
466 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  34.3 
 
 
453 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  37.61 
 
 
445 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 
459 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.39 
 
 
445 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.46 
 
 
452 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.61 
 
 
445 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.33 
 
 
456 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
464 aa  223  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  37.39 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  33.18 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.39 
 
 
445 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.39 
 
 
445 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  34.97 
 
 
452 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  32.81 
 
 
449 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  36.94 
 
 
445 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  37.16 
 
 
445 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  34 
 
 
468 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  34.76 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  37 
 
 
447 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  36.79 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  37 
 
 
447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  33.86 
 
 
455 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.21 
 
 
455 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  31.03 
 
 
457 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30.84 
 
 
453 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  32.36 
 
 
450 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  34.99 
 
 
475 aa  203  5e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 
448 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  33.7 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  32.47 
 
 
448 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  30.75 
 
 
455 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  31.91 
 
 
449 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.56 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  30.67 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.77 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  33.86 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  30.91 
 
 
446 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  33.26 
 
 
447 aa  197  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  29.64 
 
 
453 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  30.8 
 
 
442 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  30.24 
 
 
448 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  31.33 
 
 
455 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  32.43 
 
 
450 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  30.77 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  30.92 
 
 
454 aa  190  4e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  35.12 
 
 
451 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  30.84 
 
 
431 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  35.75 
 
 
452 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  30.58 
 
 
443 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  32.17 
 
 
449 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  35.6 
 
 
452 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  31.36 
 
 
446 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  31.36 
 
 
446 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>