More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09978 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 112 aa  229  8.000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  73.45 
 
 		 113 aa  169  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  74.04 
 
 		 113 aa  167  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  56.88 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  57.69 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  51 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  52.53 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  53.54 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  49.07 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  38.78 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 176 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  30.63 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 96 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  35.92 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  33.63 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  32.14 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  29.57 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  30.63 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  33.04 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  29.57 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  32.14 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  29.47 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  32.43 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  36.89 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  31.19 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>