20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00280 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00280  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  38.37 
 
 		 1072 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1070 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1006 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  34.57 
 
 		 1155 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2401  hypothetical protein  30.68 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1023 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1059 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  24.73 
 
 		 1018 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  34.62 
 
 		 1041 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 1123 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1016 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1052 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  30.49 
 
 		 914 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6188  hypothetical protein  25.52 
 
 		 247 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.19766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1129 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 735 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 1154 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 1064 aa  40.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 		 1006 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>