222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0902 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  56.23 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  53 
 
 		 278 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  55.72 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  49.46 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 289 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  52.22 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  52.79 
 
 		 285 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 274 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  50.76 
 
 		 278 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3547  XRE family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  40.6 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  43.61 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  40.7 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  39.25 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  38.24 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 263 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  39.85 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1269  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  36.96 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  39.15 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  37.85 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  38.52 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0038  helix-turn-helix domain protein  39.71 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.04 
 
 		 278 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  38.52 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  40.07 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  39.08 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0025  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3367  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  38.43 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  36.43 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  39.93 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  39.2 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  39.6 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  36.53 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  30.22 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  36.26 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1731  hypothetical protein  33.83 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  38.27 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  37.02 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 313 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  40.91 
 
 		 299 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  36.76 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  39.13 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0023  XRE family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2362  helix-turn-helix domain-containing protein  39.04 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  37.2 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  37.55 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3414  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  35.55 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  34.62 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  35.74 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  37.3 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  36.94 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  39.92 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1115  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  34.91 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  36.67 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1066  transcriptional regulator, XRE family  38.65 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  36.29 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  37.09 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5755  XRE family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47890  hypothetical protein  33.46 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000556405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  37.88 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2182  XRE family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00977715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>