79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0649 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  100 
 
 
417 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  41.05 
 
 
372 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  28.51 
 
 
392 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  27.6 
 
 
392 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  27.6 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  29.3 
 
 
729 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.15 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.15 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
728 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.43 
 
 
1119 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
728 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  33.88 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  30.1 
 
 
726 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  35.51 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  33.58 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  33.58 
 
 
394 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.43 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
705 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  21.14 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.43 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  22.78 
 
 
388 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  30 
 
 
783 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  34.48 
 
 
783 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  33.96 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  35.24 
 
 
378 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  31.17 
 
 
407 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  31.73 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  30.71 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.44 
 
 
477 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  30 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
403 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  25.95 
 
 
376 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  27.17 
 
 
751 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  32.74 
 
 
1293 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.52 
 
 
477 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  25.6 
 
 
741 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  29.56 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.99 
 
 
378 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
385 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  28.44 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 
378 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  28.69 
 
 
754 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  27.17 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  33 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
378 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
395 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
903 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
388 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  25.93 
 
 
370 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  28.15 
 
 
416 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  31.97 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  32 
 
 
814 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  32.08 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  26.57 
 
 
942 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  31.25 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
400 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
463 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  28.65 
 
 
407 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  22.38 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  19.6 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
373 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>