More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0467 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  84.63 
 
 
657 aa  1108    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  58.47 
 
 
616 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  100 
 
 
654 aa  1346    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  58.54 
 
 
413 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  49.79 
 
 
523 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  47.08 
 
 
535 aa  243  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  47.15 
 
 
570 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  50.21 
 
 
698 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  46.18 
 
 
491 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  50.66 
 
 
497 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
611 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  46.5 
 
 
291 aa  206  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  41.64 
 
 
292 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  39.05 
 
 
586 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  28.48 
 
 
636 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  26.07 
 
 
587 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  39.62 
 
 
301 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  41.37 
 
 
289 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  32.09 
 
 
603 aa  171  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 
616 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  37.5 
 
 
286 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.93 
 
 
554 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  36.36 
 
 
284 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  38.4 
 
 
802 aa  164  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  34.51 
 
 
620 aa  163  9e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  36.47 
 
 
283 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  34.86 
 
 
282 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  30.87 
 
 
416 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
618 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  36.58 
 
 
288 aa  161  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  40.6 
 
 
277 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  37.55 
 
 
293 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 
637 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  38.87 
 
 
617 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  38.72 
 
 
820 aa  158  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  35.46 
 
 
628 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  39.08 
 
 
882 aa  156  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  41.1 
 
 
358 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
625 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  37.45 
 
 
781 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
593 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  39.76 
 
 
892 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  37.07 
 
 
292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  39.11 
 
 
292 aa  153  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  35.5 
 
 
303 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  38.78 
 
 
346 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  38.27 
 
 
925 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  39.21 
 
 
267 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
621 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  38.98 
 
 
269 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  40.41 
 
 
538 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
637 aa  151  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4743  protein of unknown function DUF323  38.02 
 
 
426 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
620 aa  150  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  37.83 
 
 
611 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  36.75 
 
 
338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  35.14 
 
 
556 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  36.69 
 
 
246 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  37.18 
 
 
551 aa  148  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  35.8 
 
 
654 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  39.24 
 
 
740 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  38.84 
 
 
336 aa  147  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  37.19 
 
 
929 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  37.77 
 
 
287 aa  147  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  40.19 
 
 
351 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  37.5 
 
 
522 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  37.84 
 
 
1911 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  40.21 
 
 
240 aa  146  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  37.71 
 
 
623 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  35.34 
 
 
549 aa  144  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  34.98 
 
 
600 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  37.45 
 
 
877 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  29.72 
 
 
486 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  31.48 
 
 
477 aa  140  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  35.66 
 
 
1104 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  37.61 
 
 
446 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  35 
 
 
1196 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  36.51 
 
 
527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  31.51 
 
 
952 aa  136  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  32.16 
 
 
287 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  37.75 
 
 
1132 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  36.02 
 
 
281 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 
639 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  37.56 
 
 
862 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 
639 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  33.92 
 
 
576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  36.05 
 
 
664 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.4 
 
 
502 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  33.66 
 
 
922 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.85 
 
 
971 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.55 
 
 
971 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.85 
 
 
398 aa  126  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  32.58 
 
 
453 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  36.55 
 
 
293 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0221  protein of unknown function DUF323  32.49 
 
 
293 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.411087  normal  0.267436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  35.52 
 
 
305 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  33.44 
 
 
509 aa  125  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  37.34 
 
 
263 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.61 
 
 
826 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  35.81 
 
 
475 aa  124  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>