296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4271 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  89.14 
 
 
447 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
439 aa  905    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  71.3 
 
 
430 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  31 
 
 
455 aa  205  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  30.84 
 
 
449 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  31.71 
 
 
709 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
701 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  31.03 
 
 
702 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  33.03 
 
 
727 aa  193  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  31.45 
 
 
412 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  29.93 
 
 
709 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  31.57 
 
 
700 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  30.57 
 
 
702 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  30.57 
 
 
702 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  29.01 
 
 
704 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  30.65 
 
 
726 aa  187  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  29.01 
 
 
704 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  29.01 
 
 
704 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  28.38 
 
 
705 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  28.51 
 
 
699 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  30.22 
 
 
716 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  32.38 
 
 
446 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  31.8 
 
 
701 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  27.84 
 
 
699 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
704 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  28.86 
 
 
703 aa  183  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  28.41 
 
 
699 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  27.84 
 
 
699 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  32.44 
 
 
437 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  29.41 
 
 
722 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  28.76 
 
 
696 aa  176  8e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  29.27 
 
 
747 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  30.02 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  26.71 
 
 
701 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  35.45 
 
 
439 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  34.92 
 
 
433 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  36.31 
 
 
442 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  35.17 
 
 
442 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  29.42 
 
 
1020 aa  169  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  36.62 
 
 
444 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  35.65 
 
 
553 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  35.67 
 
 
444 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  28.96 
 
 
416 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
416 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  38.15 
 
 
468 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  31.5 
 
 
446 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  27.51 
 
 
933 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  29.94 
 
 
766 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  33.7 
 
 
436 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  38.64 
 
 
437 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  33.7 
 
 
436 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  33.7 
 
 
436 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  34.98 
 
 
506 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  33.97 
 
 
447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  29.37 
 
 
423 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  34.31 
 
 
487 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10996  DUF323 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15650)  27.87 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.742402  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  34.62 
 
 
442 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  32.31 
 
 
429 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  29.27 
 
 
444 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
446 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  30.02 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  30.84 
 
 
434 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  31.79 
 
 
434 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  27.4 
 
 
436 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  31.5 
 
 
434 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  34.18 
 
 
425 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  32.48 
 
 
455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  32.73 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  29.16 
 
 
412 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  31.46 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  28.61 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  33.87 
 
 
429 aa  127  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  30.75 
 
 
423 aa  126  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  28.79 
 
 
422 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  28.87 
 
 
425 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  27.5 
 
 
425 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  30.89 
 
 
398 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  28.15 
 
 
426 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  30.75 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  32.53 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  27.63 
 
 
437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  30.46 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  30.03 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  27.17 
 
 
438 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  25.51 
 
 
423 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  27.48 
 
 
430 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  27.93 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  29.16 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  30.86 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  31.9 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  35.86 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  30.86 
 
 
415 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  25.88 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  25.23 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  30 
 
 
430 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  31.37 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  30.27 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  29.01 
 
 
470 aa  117  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  32.52 
 
 
420 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>