More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3348 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
223 aa  457  1e-128  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  91.93 
 
 
223 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  78.48 
 
 
223 aa  367  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 
220 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  76.96 
 
 
220 aa  344  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  76.5 
 
 
220 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  77.06 
 
 
221 aa  341  6e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  77.06 
 
 
221 aa  341  6e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  76.15 
 
 
221 aa  337  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  76.5 
 
 
220 aa  330  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  73.73 
 
 
229 aa  327  1e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  72.35 
 
 
220 aa  325  4e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  72.35 
 
 
229 aa  324  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  71.89 
 
 
220 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  72.22 
 
 
220 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  71.89 
 
 
220 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  71.89 
 
 
220 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  71.89 
 
 
229 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  50.23 
 
 
224 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  46.54 
 
 
226 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  46.54 
 
 
226 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  45.62 
 
 
229 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  48.54 
 
 
240 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  44.95 
 
 
227 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  46.88 
 
 
227 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  44.81 
 
 
213 aa  174  1e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 
214 aa  174  1e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 
214 aa  174  1e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 
212 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  45.02 
 
 
233 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  45.07 
 
 
224 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  42.45 
 
 
212 aa  163  2e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  43.6 
 
 
215 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  40.47 
 
 
213 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  41.23 
 
 
218 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  41.06 
 
 
224 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  39.72 
 
 
224 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  43.96 
 
 
218 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  41.8 
 
 
185 aa  141  1e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  40.67 
 
 
225 aa  138  5e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  37.09 
 
 
230 aa  132  4e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  43.27 
 
 
230 aa  130  1e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 
214 aa  129  4e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.27 
 
 
213 aa  128  9e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
220 aa  121  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
210 aa  119  4e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
209 aa  119  4e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 
237 aa  117  2e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
209 aa  116  2e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 
233 aa  114  8e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 
440 aa  114  2e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 
208 aa  112  4e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
240 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.95 
 
 
203 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.17 
 
 
205 aa  111  8e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
207 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
215 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
215 aa  111  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
215 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.47 
 
 
203 aa  111  1e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 
223 aa  110  1e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 
214 aa  110  1e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.99 
 
 
203 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.47 
 
 
203 aa  108  4e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
217 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 
223 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 
215 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.47 
 
 
203 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.99 
 
 
203 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
215 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
215 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  33.79 
 
 
215 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
188 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
215 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
215 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
215 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
215 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
215 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
215 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 
209 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.12 
 
 
427 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 
202 aa  104  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  32.27 
 
 
216 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
201 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
200 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
201 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 
215 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 
215 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 
215 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 
215 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 
215 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
208 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 
201 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.02 
 
 
203 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.5 
 
 
203 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  34.13 
 
 
207 aa  102  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.55 
 
 
222 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 
216 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
206 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.55 
 
 
222 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>