67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2268 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  94.25 
 
 		 365 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 365 aa  755    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  97.53 
 
 		 365 aa  721    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  85 
 
 		 366 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  83.29 
 
 		 366 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  83.29 
 
 		 366 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  82.74 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  82.74 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  83.43 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  83.7 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  82.74 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  83.15 
 
 		 366 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  82.74 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  83.43 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  83.7 
 
 		 366 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  54.75 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  53.67 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  53.67 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  53.54 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  56.5 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  51.25 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  52.25 
 
 		 392 aa  381  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  55.49 
 
 		 385 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  52.16 
 
 		 393 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  52.97 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  52.26 
 
 		 380 aa  353  4e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  51 
 
 		 367 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  52.97 
 
 		 389 aa  348  6e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  51.25 
 
 		 385 aa  342  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  47.11 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  48.72 
 
 		 376 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  51.32 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  47.79 
 
 		 376 aa  332  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  47.08 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  47.08 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  40.28 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  41.41 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  37.88 
 
 		 360 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  37.6 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  31.06 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  28.46 
 
 		 392 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  30.22 
 
 		 385 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  27.1 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  27.5 
 
 		 348 aa  119  9e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  31.5 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  27.7 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  30.04 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  23.49 
 
 		 369 aa  86.7  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  34.26 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  25.93 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  25.79 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 		 222 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  33.05 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  24.31 
 
 		 748 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  22.67 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  34.75 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  33.05 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  33.05 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  32.2 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  32.2 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  32.2 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  27.34 
 
 		 934 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  32.2 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2697  hypothetical protein  27.22 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  23.65 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 377 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>