More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7453 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7453  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  91.19 
 
 		 263 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  80.97 
 
 		 255 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  78.97 
 
 		 256 aa  344  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  77.13 
 
 		 256 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  77.13 
 
 		 256 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  77.87 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  71.56 
 
 		 257 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  68.52 
 
 		 251 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  68.06 
 
 		 251 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  66.52 
 
 		 259 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  67.58 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  67.58 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  67.12 
 
 		 254 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  63.52 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  65.45 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  62.73 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  62.73 
 
 		 254 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  62.73 
 
 		 254 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  62.73 
 
 		 254 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  62.73 
 
 		 254 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  62.73 
 
 		 254 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  62.73 
 
 		 254 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  47.69 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  39.44 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1719  GntR domain-containing protein  41.59 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  hitchhiker  0.00929417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  36.99 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  39.04 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  36.62 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  38.25 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  36.45 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  39.53 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  36.63 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  38.74 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  34.23 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  36.4 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  37.2 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  39.81 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  31.7 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  34.42 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  34.93 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.41 
 
 		 258 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  36.41 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  36.41 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.41 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.41 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  36.41 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  42.46 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.41 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.41 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.89 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  35.98 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.94 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  33.49 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  33.64 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.02 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.02 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.02 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  35.21 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  35.21 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  35.21 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  33.95 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.92 
 
 		 258 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  33.49 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  33.49 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  34.74 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  33.8 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  33.8 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  33.8 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  33.49 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.64 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  33.8 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  33.8 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  33.8 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  33.8 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>