57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3351 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5636  NERD domain-containing protein  72.94 
 
 		 557 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748755  normal  0.450463 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0275  hypothetical protein  74 
 
 		 554 aa  845    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0985894  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4896  NERD domain protein  85.02 
 
 		 564 aa  983    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0805838 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0546  hypothetical protein  74 
 
 		 554 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.946495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  73.82 
 
 		 554 aa  842    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1281  hypothetical protein  73.82 
 
 		 554 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0983409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4664  hypothetical protein  73.31 
 
 		 557 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4052  hypothetical protein  71.53 
 
 		 555 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1020  hypothetical protein  74 
 
 		 554 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.44837  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 557 aa  1139    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3704  hypothetical protein  73.31 
 
 		 557 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.064418  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1774  hypothetical protein  82.95 
 
 		 573 aa  966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245885  hitchhiker  0.0000023235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4510  NERD domain-containing protein  71.71 
 
 		 555 aa  817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1463  hypothetical protein  74 
 
 		 626 aa  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1159  hypothetical protein  73.01 
 
 		 555 aa  831    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2536  hypothetical protein  74 
 
 		 554 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4026  NERD domain-containing protein  72.11 
 
 		 555 aa  793    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1296  hypothetical protein  74 
 
 		 669 aa  844    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  54.3 
 
 		 544 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  51.62 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  37.68 
 
 		 541 aa  324  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  37.08 
 
 		 540 aa  310  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  35.66 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4576  AAA ATPase  36.68 
 
 		 533 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  26.42 
 
 		 559 aa  99.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  30.38 
 
 		 574 aa  88.6  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  26.52 
 
 		 579 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  26.24 
 
 		 606 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  24.92 
 
 		 568 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  26.02 
 
 		 549 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  26.94 
 
 		 593 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  24.85 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  24.85 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  25.36 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  27.3 
 
 		 601 aa  65.1  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  23.67 
 
 		 551 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  26.85 
 
 		 615 aa  62  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3317  NERD domain protein  26.21 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  23.72 
 
 		 617 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  26.47 
 
 		 617 aa  57  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  25.29 
 
 		 551 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  21.99 
 
 		 616 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  21.13 
 
 		 613 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  26.05 
 
 		 610 aa  56.6  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  25.77 
 
 		 625 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  25.41 
 
 		 632 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  28.67 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  22.95 
 
 		 612 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2752  hypothetical protein  33.59 
 
 		 324 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.172027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.86 
 
 		 607 aa  50.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  27.72 
 
 		 615 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  23.2 
 
 		 827 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  25.07 
 
 		 593 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  28.3 
 
 		 634 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  25.48 
 
 		 607 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  25.41 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  36.14 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>