More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1258 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
276 aa  539  1e-152  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  62.08 
 
 
273 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.91 
 
 
277 aa  262  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.35 
 
 
276 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.51 
 
 
273 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.6 
 
 
277 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.45 
 
 
277 aa  254  1e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.89 
 
 
278 aa  251  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.58 
 
 
301 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.04 
 
 
272 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.84 
 
 
281 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.73 
 
 
281 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.63 
 
 
266 aa  244  1e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.2 
 
 
277 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  9.08822e-07 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.96 
 
 
277 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.44 
 
 
278 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.14 
 
 
274 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.55 
 
 
273 aa  221  1e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.12 
 
 
274 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.5 
 
 
275 aa  215  6e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.03 
 
 
275 aa  214  1e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.47 
 
 
293 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.39 
 
 
269 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.01 
 
 
271 aa  195  8e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.13 
 
 
273 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
269 aa  190  3e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.43 
 
 
273 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.92 
 
 
273 aa  183  2e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 
271 aa  182  5e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 
271 aa  182  5e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.8 
 
 
255 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
280 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 
271 aa  173  4e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.88 
 
 
268 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.81 
 
 
267 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 
300 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 
289 aa  169  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.77 
 
 
275 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
273 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.75 
 
 
289 aa  166  3e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.96 
 
 
273 aa  166  3e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.15 
 
 
271 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 
285 aa  164  1e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.44 
 
 
273 aa  165  1e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
278 aa  164  2e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 
271 aa  162  5e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 
270 aa  162  5e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 
274 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.37 
 
 
268 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.75 
 
 
270 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  39.93 
 
 
283 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.98 
 
 
270 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
270 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 
270 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.13 
 
 
273 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.6 
 
 
280 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.56 
 
 
272 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.01037e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 
274 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41 
 
 
272 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
273 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 
272 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
270 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
270 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
270 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 
270 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.46 
 
 
272 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 
276 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.46 
 
 
272 aa  153  3e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.22 
 
 
270 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
270 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
270 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
270 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 
270 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
273 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 
272 aa  152  6e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
286 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
272 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
270 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
270 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 
275 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.08 
 
 
272 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.21 
 
 
270 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
264 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.54 
 
 
274 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2478  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 
271 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0810404  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 
260 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.08 
 
 
272 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
272 aa  149  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 
272 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.27 
 
 
279 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.38 
 
 
269 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.7 
 
 
272 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 
271 aa  148  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.56 
 
 
282 aa  148  1e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  6.14659e-09 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.48 
 
 
271 aa  147  1e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 
272 aa  147  2e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 
272 aa  147  2e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
282 aa  147  2e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
268 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>