More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31890 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
353 aa  714    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  66.98 
 
 
332 aa  447  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  65.64 
 
 
340 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  66.46 
 
 
333 aa  450  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  64.56 
 
 
346 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  69.77 
 
 
344 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  61.38 
 
 
359 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  65.03 
 
 
330 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  64.08 
 
 
313 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  64.5 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  65.61 
 
 
348 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  61.9 
 
 
333 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  62.95 
 
 
319 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  62.1 
 
 
333 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  65.15 
 
 
317 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  63.43 
 
 
336 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  62.1 
 
 
333 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  62.01 
 
 
318 aa  401  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  62.66 
 
 
318 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  62.1 
 
 
333 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  62.21 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  63.61 
 
 
310 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  60.74 
 
 
330 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  65.47 
 
 
348 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  61.88 
 
 
329 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  63.16 
 
 
325 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  63.52 
 
 
309 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  61.31 
 
 
330 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  59.87 
 
 
310 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  65.6 
 
 
327 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  58.49 
 
 
335 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  62.09 
 
 
329 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  59.87 
 
 
310 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  59.43 
 
 
327 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  56.8 
 
 
361 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  56.73 
 
 
313 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  59.03 
 
 
331 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  57.98 
 
 
325 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  58.22 
 
 
318 aa  362  6e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  53.59 
 
 
339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  59.87 
 
 
325 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  61.78 
 
 
317 aa  355  5e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  61.15 
 
 
362 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  54.25 
 
 
319 aa  338  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  55.49 
 
 
325 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  56.09 
 
 
320 aa  332  5e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  51.97 
 
 
334 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  53.62 
 
 
311 aa  326  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  54.61 
 
 
311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
334 aa  325  5e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  51.79 
 
 
311 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  53.38 
 
 
322 aa  325  9e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  53.44 
 
 
320 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  53.27 
 
 
311 aa  323  4e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  52.48 
 
 
332 aa  322  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  52.12 
 
 
311 aa  322  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  54.28 
 
 
318 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  49.7 
 
 
361 aa  319  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  51.32 
 
 
311 aa  316  4e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
311 aa  315  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  49.5 
 
 
320 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  48.54 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  49.34 
 
 
316 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  52.61 
 
 
314 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  52.61 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  52.6 
 
 
345 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  52.29 
 
 
323 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
456 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  53.77 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  50.96 
 
 
461 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  50.96 
 
 
461 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  52.3 
 
 
321 aa  305  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  52.29 
 
 
321 aa  305  7e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
460 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  50 
 
 
314 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  51.32 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  50 
 
 
324 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
314 aa  302  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
326 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  47.88 
 
 
315 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
332 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  51.77 
 
 
458 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  50.99 
 
 
321 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  48.56 
 
 
453 aa  299  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  49.35 
 
 
324 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  49.67 
 
 
321 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
313 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
319 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  47.65 
 
 
319 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  45.34 
 
 
314 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
317 aa  295  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  52.29 
 
 
314 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
312 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  46.3 
 
 
460 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  51.27 
 
 
321 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  45.16 
 
 
323 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  49.36 
 
 
335 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  49.21 
 
 
333 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>