More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19190 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  100 
 
 
247 aa  485  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2454  ATP synthase F0, A subunit  48.61 
 
 
272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1066  ATP synthase F0, A subunit  48.19 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  48.19 
 
 
282 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  46.37 
 
 
294 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  47.01 
 
 
281 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1129  F0F1 ATP synthase subunit A  44.31 
 
 
270 aa  217  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  46.56 
 
 
283 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0142  ATP synthase F0, A subunit  44.58 
 
 
284 aa  199  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  37.79 
 
 
259 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1801  ATP synthase F0, A subunit  40.69 
 
 
257 aa  148  8e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  32.93 
 
 
265 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  39.35 
 
 
265 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  36.4 
 
 
275 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  36.6 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  36.36 
 
 
272 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  35.2 
 
 
270 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  36.44 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  37.1 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  36.64 
 
 
285 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  34.48 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  38.43 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  35.77 
 
 
263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  34.18 
 
 
263 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  39.72 
 
 
280 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  37.75 
 
 
284 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  35.57 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  33.2 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  34.48 
 
 
266 aa  119  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  37.1 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  37.1 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  37.1 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  37.44 
 
 
276 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  36.2 
 
 
251 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  35.62 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  34.7 
 
 
251 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  37.25 
 
 
268 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4487  F0F1 ATP synthase subunit A  36.86 
 
 
406 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.553444  normal  0.0963007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  34.47 
 
 
241 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 
250 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4624  ATP synthase F0, A subunit  33.09 
 
 
312 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  36.13 
 
 
258 aa  102  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  32.68 
 
 
261 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  32.77 
 
 
249 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  33.99 
 
 
253 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  35.92 
 
 
341 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0392  ATP synthase F0, A subunit  35.34 
 
 
373 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.726287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 
250 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  33.05 
 
 
243 aa  100  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  35.41 
 
 
345 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  35.9 
 
 
251 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  39.13 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  34.32 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  32.9 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  32.63 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1055  ATP synthase F0, A subunit  32.77 
 
 
391 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  31.62 
 
 
342 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4495  F0F1 ATP synthase subunit A  35.06 
 
 
384 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  33.9 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  33.07 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  35.45 
 
 
258 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  36.65 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  35.24 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  32.47 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  32.79 
 
 
250 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  32.22 
 
 
260 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  37.21 
 
 
247 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  32.38 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2885  F0F1 ATP synthase subunit A  32.46 
 
 
340 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000677372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  30.48 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  35.75 
 
 
248 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  33.47 
 
 
260 aa  92  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  34.31 
 
 
247 aa  92  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  31.17 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  33.2 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1718  ATP synthase F0, A subunit  33.94 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0314608  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  33.66 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  35.12 
 
 
373 aa  89.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  37.45 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  34.93 
 
 
261 aa  89  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  31.28 
 
 
364 aa  88.6  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 
248 aa  88.6  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  34.23 
 
 
247 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0311  ATP synthase F0, A subunit  35.29 
 
 
400 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00150281  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2247  F0F1 ATP synthase subunit A  33.6 
 
 
324 aa  87  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.608191  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  38.12 
 
 
339 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  33.89 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0179  ATP synthase, subunit A (H(+)-transporting two-sector ATPase)  33.77 
 
 
376 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.412196  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  33.63 
 
 
216 aa  85.9  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  30.51 
 
 
233 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4476  F0F1 ATP synthase subunit A  32.53 
 
 
384 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
247 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  32.58 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4340  F0F1 ATP synthase subunit A  31.87 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.35318  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  33.63 
 
 
207 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  30.34 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  31.75 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>