More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3092 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  96.2 
 
 		 158 aa  304  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  96.2 
 
 		 158 aa  304  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  95.57 
 
 		 175 aa  303  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  95.57 
 
 		 158 aa  302  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  95.57 
 
 		 158 aa  302  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  95.57 
 
 		 158 aa  302  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  95.57 
 
 		 158 aa  302  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  96.2 
 
 		 175 aa  302  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  94.94 
 
 		 175 aa  301  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  95.57 
 
 		 175 aa  301  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  79.11 
 
 		 158 aa  253  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  79.11 
 
 		 159 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  61.94 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  60.39 
 
 		 156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  59.49 
 
 		 162 aa  187  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  65.41 
 
 		 158 aa  187  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  64.15 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  64.15 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 160 aa  176  9e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  62.34 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  54.19 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  52.67 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  48.41 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 157 aa  150  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 162 aa  147  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  50.67 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 163 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  49.66 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  47.37 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  54.36 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  46.79 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 168 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  46.75 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  46.58 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>