More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0244 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 291 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.44 
 
 		 291 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.44 
 
 		 291 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.44 
 
 		 291 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.71 
 
 		 293 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.71 
 
 		 293 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.64 
 
 		 291 aa  325  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.16 
 
 		 290 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.05 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 		 276 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.08 
 
 		 282 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.74 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.38 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.29 
 
 		 293 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.26 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 		 296 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  44.12 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  44.12 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  44.12 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  41.82 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 284 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 287 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 		 279 aa  208  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  42.96 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  43.64 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  42.7 
 
 		 303 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.28 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 		 283 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 277 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  40.58 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 281 aa  195  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 		 281 aa  195  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 		 274 aa  191  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 285 aa  191  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  38.41 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  38.69 
 
 		 278 aa  188  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 		 283 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 		 274 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  41.16 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  37.09 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.45 
 
 		 284 aa  183  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  38.01 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 		 276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 282 aa  178  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  34.85 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 279 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>