More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4699 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.95 
 
 		 212 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  37.62 
 
 		 212 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 210 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 231 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  31.1 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  35.1 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  30.88 
 
 		 220 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  35.47 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  35.47 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  35.47 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  35.47 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  35.47 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  35.47 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  33.02 
 
 		 213 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  35.47 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  34.78 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  34.15 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  33.01 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  32.52 
 
 		 213 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  33.01 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  33.01 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  34.58 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  32.51 
 
 		 214 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  30.92 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3388  two-component response regulator transcription regulator protein  33.65 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0201761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  30.92 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  30.92 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  30.92 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  29.95 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  29.95 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  31.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  29.95 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0356  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  29.47 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 215 aa  102  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0880  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.37 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  30.14 
 
 		 214 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  29.9 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1157  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 216 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>