34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3940 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3940  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  324  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.007484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3580  hypothetical protein  98.08 
 
 		 176 aa  287  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2538  hypothetical protein  84.66 
 
 		 176 aa  237  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5314  hypothetical protein  82.39 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5105  hypothetical protein  78.24 
 
 		 182 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1448  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  47.4 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0819  hypothetical protein  45.22 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1887  putative acyl coenzyme A thioester hydrolase protein  46.88 
 
 		 635 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.037532  normal  0.647749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2543  hypothetical protein  40.91 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2815  hypothetical protein  41.32 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1765  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  43.43 
 
 		 630 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2088  Bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase  44.63 
 
 		 626 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.893347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0092  hypothetical protein  44.51 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0418  hypothetical protein  40.26 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4849  hypothetical protein  38.14 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.95 
 
 		 398 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05600  hypothetical protein  39.24 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.432853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.55 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.44 
 
 		 377 aa  62  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2317  hypothetical protein  32.97 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.451279 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3852  hypothetical protein  33.54 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.367857 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7170  hypothetical protein  30.16 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.61 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.76 
 
 		 377 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.17 
 
 		 372 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1052  hypothetical protein  34.25 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.27 
 
 		 369 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.72 
 
 		 372 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0667  hypothetical protein  48.33 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116173  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4900  hypothetical protein  31.89 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.48 
 
 		 396 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.66 
 
 		 371 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2359  putative oxidoreductase  29.06 
 
 		 375 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.93 
 
 		 472 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>