107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6789 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6789  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 165 aa  333  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  51.32 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  36.5 
 
 		 140 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  41.94 
 
 		 147 aa  90.5  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  40.8 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  40 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5666  lytic transglycosylase catalytic  41.27 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326026  hitchhiker  0.0069947 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  38.76 
 
 		 161 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  38.76 
 
 		 161 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  38.76 
 
 		 161 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  41.18 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  38.1 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  39.67 
 
 		 216 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  37.3 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5883  lytic transglycosylase, catalytic  41.27 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.161206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3138  Lytic transglycosylase catalytic  39.31 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.82617  normal  0.443685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  43.51 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  40.17 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  46.49 
 
 		 161 aa  84  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  39.32 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  40.68 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  39.32 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  39.32 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  41.13 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  34.52 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.6 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0043  lytic transglycosylase  36.23 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  43.44 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  43.44 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2772  Lytic transglycosylase catalytic  40.34 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  36.62 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03391  Hpa2  41.67 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  42.31 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  35.97 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  33.81 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4125  lytic transglycosylase PilT  32.54 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476698 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  35.96 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  39.34 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05356  putative lipoprotein  37.8 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.592846  normal  0.453874 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0005  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.59 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_23  transglycosylase PilT  37.6 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.846222  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  39.52 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  41.74 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  32.08 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  32.08 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  32.08 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  32.08 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  32.08 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6234  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4280  lytic transglycosylase, catalytic  32.81 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  34.71 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  39.31 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1531  Lytic transglycosylase catalytic  40.32 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5196  Lytic transglycosylase catalytic  40.32 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0111  lytic transglycosylase PilT  33.59 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  33.09 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5233  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00145184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  35.04 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0163  lytic transglycosylase, catalytic  39.18 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0042056  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  34.36 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  37.25 
 
 		 438 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0860  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  38.78 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  35.86 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 239 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  36.36 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 408 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 213 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 599 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  38.54 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  36 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  35.2 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  35.2 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  35.2 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  35.2 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  33.88 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0834  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0042  pilT protein  34.01 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  36.51 
 
 		 210 aa  63.9  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0049  pilT protein, putative  34.85 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0011  conjugal transfer protein  32.26 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0632  Lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5437  lytic transglycosylase, catalytic  35.09 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43825  normal  0.56373 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  31.63 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1065  conjugal transfer protein, putative  31.94 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  34.82 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  28.8 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1489  Lytic transglycosylase catalytic  40.35 
 
 		 215 aa  47.4  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2003  Lytic transglycosylase catalytic  30.86 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.323498  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0106  type IV secretory pathway VirB1 component  32.26 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0562  Lytic transglycosylase catalytic  27.39 
 
 		 180 aa  44.7  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>