173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0632 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0632  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0111  lytic transglycosylase PilT  48.67 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4125  lytic transglycosylase PilT  42.31 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476698 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0049  pilT protein, putative  41.22 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0042  pilT protein  41.22 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0860  lytic transglycosylase catalytic  44.14 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720569  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0834  Lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2999  invasion protein IagB  38.28 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000303944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3082  cell invasion protein  38.28 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3187  cell invasion protein  38.28 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.927975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3066  invasion protein IagB  38.28 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.490533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1431  lytic transglycosylase, catalytic  37.98 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3030  invasion protein IagB  38.28 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0325324 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0005  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.39 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1544  lytic transglycosylase, catalytic  42.22 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0439375  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0168  protein IpgF  37.23 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00546577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2311  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5439  Lytic transglycosylase catalytic  39.37 
 
 		 145 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5033  Lytic transglycosylase catalytic  39.37 
 
 		 145 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5196  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1531  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2644  lytic transglycosylase, catalytic  39.85 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1938  lytic transglycosylase catalytic  40.19 
 
 		 438 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0154763 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0379  invasion protein  37.38 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2121  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.98 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6296  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1265  lytic transglycosylase catalytic  37.27 
 
 		 407 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.254605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1239  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 404 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4498  lytic transglycosylase, catalytic  37.38 
 
 		 404 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0873  lytic transglycosylase, catalytic  37.38 
 
 		 599 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1355  lytic transglycosylase, catalytic  37.38 
 
 		 408 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0669029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1337  lytic transglycosylase catalytic  37.38 
 
 		 408 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.545884  normal  0.0328335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0248  Lytic transglycosylase catalytic  34.15 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5422  Lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984316  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5017  Lytic transglycosylase catalytic  38.05 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_23  transglycosylase PilT  35.59 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.846222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5072  transglycosylase SLT domain protein  31.5 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.110513 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0193  lytic transglycosylase, catalytic  37.17 
 
 		 168 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0007  lytic transglycosylase, catalytic  35.59 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0063  lytic transglycosylase, catalytic  35.59 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0219  HpaH precursor  34.75 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0006  putative invasion protein  34.75 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0006  putative invasion protein  34.75 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2787  ipgF protein, putative  34.75 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.062319  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1891  putative ipgF protein  34.75 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2661  putative ipgF protein  34.75 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0006  BapC protein  34.75 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7409  Lytic transglycosylase catalytic  39.68 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3519  putative ipgF protein  34.75 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4280  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3245  lytic transglycosylase  35.59 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0053  lytic transglycosylase, catalytic  35.59 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6566  lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0063  lytic transglycosylase catalytic  35.59 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0082  lytic transglycosylase catalytic  35.59 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0195  lytic transglycosylase catalytic protein  32.03 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5550  lytic transglycosylase catalytic  33.61 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0239978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000012846 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0043  lytic transglycosylase  33.09 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0064  lytic transglycosylase catalytic  34.75 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0565  BapC protein  31.97 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.146526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1524  BapC protein  31.97 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177877  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2079  BapC protein  31.97 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.22209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2068  BapC protein  31.97 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0527025  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0760  BapC protein  31.97 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.832936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3935  Lytic transglycosylase catalytic  33.05 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2156  BapC protein  31.97 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1033  Lytic transglycosylase catalytic  42.27 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5894  lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.431421  normal  0.0993718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4502  hypothetical protein  33.05 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3069  lytic transglycosylase catalytic  33.05 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0847  BapC protein  31.97 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3796  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.823369  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6789  lytic transglycosylase, catalytic  29.75 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2099  lytic transglycosylase, catalytic  33.86 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0964  Lytic transglycosylase catalytic  31.3 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0011  conjugal transfer protein  29.23 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4243  lytic transglycosylase, catalytic  32.69 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5666  lytic transglycosylase catalytic  30.89 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326026  hitchhiker  0.0069947 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6234  lytic transglycosylase catalytic  30.47 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4488  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05356  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.592846  normal  0.453874 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5883  lytic transglycosylase, catalytic  31.86 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.161206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0014  conserved hypothetical protein, SLT family  31.82 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3673  lytic transglycosylase catalytic  32.2 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.25232 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4187  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000629  decreased coverage  0.0000117899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2361  lytic transglycosylase, catalytic  27.81 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1098  Lytic transglycosylase catalytic  28.8 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.891571  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4766  Lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1088  Lytic transglycosylase catalytic  30.6 
 
 		 304 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  34.75 
 
 		 359 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2896  hypothetical protein  30.69 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  30.58 
 
 		 798 aa  51.2  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  34.82 
 
 		 603 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  33.9 
 
 		 359 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  33.9 
 
 		 359 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  33.9 
 
 		 359 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  33.9 
 
 		 359 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  33.9 
 
 		 359 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  33.9 
 
 		 360 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>