More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0941 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  615  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.82 
 
 
290 aa  259  6e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
294 aa  246  3e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 
319 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
317 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
319 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  hitchhiker  0.000205378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
308 aa  202  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.732084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748515 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5738  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.36 
 
 
302 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.83 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
318 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488692  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
312 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.142654 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
323 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.939574  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
294 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493427  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
275 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
291 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
305 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180469  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2010  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  35.33 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.360583  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
332 aa  183  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
309 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
299 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1183  ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
307 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
299 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2817  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  37.63 
 
 
307 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
306 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0937011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 
302 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
334 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376076  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.94 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6025  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
305 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.825826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  36.55 
 
 
308 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
305 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
318 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  36.55 
 
 
308 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
305 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
315 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
318 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3837  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
350 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344745  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.33 
 
 
354 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.66 
 
 
320 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  35.58 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.33 
 
 
320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
310 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
297 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.255158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  35.96 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
323 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.380301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  36.88 
 
 
322 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
309 aa  162  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
294 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.200183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
294 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
298 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
296 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
323 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
297 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  35 
 
 
300 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  35.24 
 
 
318 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.71 
 
 
330 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.54 
 
 
308 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000461706  normal  0.23331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
292 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  29.86 
 
 
310 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
294 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000181172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
312 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
305 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
299 aa  158  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.27 
 
 
294 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
294 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
313 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115668  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1493  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.08 
 
 
319 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
317 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
313 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
295 aa  155  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
314 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
311 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
308 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
287 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
312 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.746865  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
288 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
306 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
300 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
305 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
312 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
299 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
300 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
300 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.6 
 
 
275 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>