263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0972 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  100 
 
 
257 aa  504  1e-142  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  92.22 
 
 
255 aa  464  1e-130  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.58659e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  90.27 
 
 
280 aa  437  1e-122  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  90.27 
 
 
255 aa  438  1e-122  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.3066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  90.27 
 
 
292 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  90.73 
 
 
250 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  97.67 
 
 
257 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  1.53015e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  73.39 
 
 
253 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  75 
 
 
253 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  68.67 
 
 
255 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  76.42 
 
 
249 aa  299  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  51.33 
 
 
258 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  41.03 
 
 
244 aa  155  5e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  44.09 
 
 
242 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  41.5 
 
 
257 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  45.24 
 
 
242 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  44.04 
 
 
242 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  41.96 
 
 
265 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  37.61 
 
 
250 aa  147  1e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  37.5 
 
 
247 aa  147  2e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  37.34 
 
 
252 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  35.83 
 
 
293 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  36.58 
 
 
273 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  39.04 
 
 
228 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  35.8 
 
 
273 aa  141  1e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  34.9 
 
 
285 aa  140  2e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  35.41 
 
 
273 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  36.24 
 
 
238 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  38.64 
 
 
245 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  38.27 
 
 
247 aa  136  3e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  36.91 
 
 
255 aa  136  3e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  36.91 
 
 
255 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  37.44 
 
 
230 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  37.24 
 
 
286 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  39.9 
 
 
231 aa  134  1e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  36.99 
 
 
228 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  38.46 
 
 
233 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  42.13 
 
 
243 aa  131  1e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  40.32 
 
 
236 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  37.84 
 
 
246 aa  129  5e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  35.62 
 
 
237 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  31.71 
 
 
244 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  37.17 
 
 
233 aa  121  1e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  37.37 
 
 
247 aa  121  1e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  30.46 
 
 
244 aa  121  1e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  35.98 
 
 
232 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  34.48 
 
 
234 aa  117  2e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  35.14 
 
 
230 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  35.14 
 
 
230 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  34.68 
 
 
230 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  33.19 
 
 
242 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  34.34 
 
 
239 aa  115  8e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  34.27 
 
 
234 aa  114  1e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  37.16 
 
 
240 aa  114  1e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  34.85 
 
 
246 aa  114  2e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  36.13 
 
 
246 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  36.93 
 
 
240 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  34.91 
 
 
242 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  38.64 
 
 
242 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  38.69 
 
 
282 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  33.02 
 
 
244 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  36.52 
 
 
241 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  38.42 
 
 
238 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  36.52 
 
 
241 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  36.52 
 
 
241 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  36.52 
 
 
241 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  36.52 
 
 
241 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  36.52 
 
 
241 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  36.52 
 
 
241 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  35.96 
 
 
241 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  36.52 
 
 
241 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  38.54 
 
 
245 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  31.28 
 
 
229 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  31.95 
 
 
240 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  33.48 
 
 
240 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  35.39 
 
 
242 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  36.21 
 
 
233 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  34.69 
 
 
244 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  31.9 
 
 
235 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  37.43 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  36.17 
 
 
239 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  30.08 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  31.87 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  33.51 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  31.3 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  31.3 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  32.47 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  40.21 
 
 
307 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  32.61 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  33.18 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  33.18 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  33.18 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  33.18 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  35.96 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  35.96 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  31.51 
 
 
258 aa  92  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  31.97 
 
 
266 aa  92  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  32.07 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  31.43 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02082  hypothetical protein  30.73 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>