More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1321 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  100 
 
 
276 aa  570  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  100 
 
 
276 aa  570  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  100 
 
 
276 aa  570  1e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  100 
 
 
276 aa  570  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  100 
 
 
276 aa  570  1e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  100 
 
 
271 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  91.67 
 
 
298 aa  524  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  100 
 
 
252 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6244  OmpA/MotB domain-containing protein  47.69 
 
 
264 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3525  OmpA/MotB domain-containing protein  44.91 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5847  OmpA/MotB:SmpA/OmlA  40.94 
 
 
292 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  44.98 
 
 
276 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 
278 aa  174  1e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0842  outer membrane protein  32.13 
 
 
273 aa  145  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0308404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  31.77 
 
 
276 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5708  hypothetical protein  41.61 
 
 
229 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  31.18 
 
 
290 aa  118  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2065  ompA family protein  32.79 
 
 
254 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  41.41 
 
 
222 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 
222 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.4 
 
 
222 aa  111  1e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 
222 aa  111  1e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 
222 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 
222 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 
222 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  42.86 
 
 
224 aa  109  4e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  42.86 
 
 
224 aa  109  4e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  42.86 
 
 
224 aa  109  4e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  42.86 
 
 
209 aa  109  4e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  42.86 
 
 
224 aa  109  4e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  42.86 
 
 
224 aa  109  4e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  42.19 
 
 
215 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  42.86 
 
 
179 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  42.06 
 
 
224 aa  108  8e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 
215 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.62 
 
 
215 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  46.09 
 
 
355 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  3.42607e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  45.31 
 
 
358 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.95857e-08  normal  0.269234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  45.31 
 
 
346 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.93272e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  45.31 
 
 
346 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.4176e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  45.31 
 
 
354 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.16879e-08  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  45.31 
 
 
350 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.3965e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  45.31 
 
 
346 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  5.0212e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  45.31 
 
 
365 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  6.98773e-08  unclonable  2.77772e-08 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  45.31 
 
 
346 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  45.31 
 
 
346 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  7.88885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2907  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.84 
 
 
372 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2394  OmpA/MotB domain protein  44.09 
 
 
240 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  43.85 
 
 
358 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  43.85 
 
 
369 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  43.85 
 
 
371 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.86695e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  43.85 
 
 
358 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  45.31 
 
 
354 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  1.18487e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6867  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 
371 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301365  normal  0.329522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  43.08 
 
 
369 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  5.33703e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  43.51 
 
 
358 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  5.40093e-10  decreased coverage  5.07763e-07 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  41.36 
 
 
357 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  41.36 
 
 
353 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  3.81188e-11  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  41.36 
 
 
353 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  8.8038e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  43.18 
 
 
225 aa  99.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  41.98 
 
 
387 aa  99  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  43.8 
 
 
236 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  43.8 
 
 
236 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  43.8 
 
 
236 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  42.98 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  42.98 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  42.98 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  42.98 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  42.19 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.45833e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.53 
 
 
235 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  41.09 
 
 
361 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.65079e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0237  OmpA/MotB domain protein  38.58 
 
 
491 aa  93.6  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  41.09 
 
 
366 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  34.75 
 
 
363 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.10923e-09  unclonable  2.19993e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  37.98 
 
 
216 aa  89  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  39.26 
 
 
207 aa  88.6  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 
373 aa  88.6  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  41.09 
 
 
376 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  5.38127e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  37.4 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
232 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  37.4 
 
 
217 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  40.69 
 
 
355 aa  85.5  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  6.58717e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  34.81 
 
 
219 aa  84.3  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  34.81 
 
 
217 aa  84  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
218 aa  84.3  2e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
218 aa  84.3  2e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 
831 aa  83.6  3e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  35.88 
 
 
218 aa  82.4  7e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  9.37501e-05  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6884  OmpA/MotB domain protein  35.53 
 
 
362 aa  81.6  1e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177157  normal  0.158984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 
831 aa  81.6  1e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  36.51 
 
 
831 aa  81.6  1e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 
242 aa  81.3  2e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  38.71 
 
 
830 aa  81.3  2e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 
219 aa  81.3  2e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 
831 aa  80.1  3e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36.13 
 
 
219 aa  80.5  3e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 
218 aa  80.1  4e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 
218 aa  80.1  4e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0793  Plp4  31.15 
 
 
138 aa  79.3  6e-14  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0192508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2929  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.64 
 
 
359 aa  79  8e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>