20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5708 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5708  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5847  OmpA/MotB:SmpA/OmlA  56.18 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  45.29 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  39.44 
 
 		 276 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.44 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.44 
 
 		 276 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  39.44 
 
 		 276 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.44 
 
 		 276 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.44 
 
 		 276 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  41.61 
 
 		 252 aa  121  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  36.68 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6244  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 278 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3525  OmpA/MotB domain-containing protein  43.07 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0842  outer membrane protein  43.65 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0308404  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0793  Plp4  35.34 
 
 		 138 aa  87  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0192508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  29.95 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2065  ompA family protein  33.82 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4599  hypothetical protein  30.21 
 
 		 147 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  27.98 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>