275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1027 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  99.64 
 
 
279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  96.38 
 
 
279 aa  558  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  77.82 
 
 
283 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  68.75 
 
 
292 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  69.26 
 
 
288 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  68.15 
 
 
288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  71.11 
 
 
299 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  67.45 
 
 
272 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  68.34 
 
 
284 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  61.17 
 
 
274 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  62.78 
 
 
268 aa  349  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  62.78 
 
 
268 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  62.88 
 
 
285 aa  344  8e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  62.2 
 
 
282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  53.98 
 
 
297 aa  309  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  60.23 
 
 
279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  57.14 
 
 
291 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  56.39 
 
 
292 aa  302  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  53.85 
 
 
303 aa  294  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  52.46 
 
 
305 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  52.88 
 
 
301 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  52.86 
 
 
299 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  54.58 
 
 
302 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  51.15 
 
 
287 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  52.33 
 
 
287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  52.33 
 
 
287 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  50.58 
 
 
287 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  48.67 
 
 
288 aa  270  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  49.81 
 
 
287 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  48.56 
 
 
299 aa  269  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  48.29 
 
 
288 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  51.16 
 
 
301 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  51.19 
 
 
289 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  49.02 
 
 
284 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  49.01 
 
 
297 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  45.95 
 
 
282 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.17 
 
 
282 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  47.04 
 
 
270 aa  246  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  45.63 
 
 
288 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  46.77 
 
 
273 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  45.38 
 
 
285 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  44.27 
 
 
291 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  43.94 
 
 
304 aa  238  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  46.92 
 
 
318 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  43.6 
 
 
315 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  44.64 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  46.54 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  45.85 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  46.15 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  46.15 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  46.15 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  40.78 
 
 
294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  45 
 
 
261 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  44.76 
 
 
276 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  42.46 
 
 
342 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  43.02 
 
 
275 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  42.39 
 
 
342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  41.7 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  41.86 
 
 
318 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  42.42 
 
 
251 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  50.9 
 
 
175 aa  185  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  53.73 
 
 
147 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  36.29 
 
 
229 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  46.24 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  44.24 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  36.53 
 
 
247 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  37.99 
 
 
245 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  41.83 
 
 
220 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  43 
 
 
247 aa  150  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  43 
 
 
263 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  41.81 
 
 
261 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  40.72 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  45.14 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  40.45 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  38.33 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  41.92 
 
 
229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  37.5 
 
 
241 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  37.72 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  43.03 
 
 
244 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  42.13 
 
 
247 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  38.33 
 
 
266 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  39.13 
 
 
260 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  41.57 
 
 
218 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  42.61 
 
 
242 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  37.02 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  38.54 
 
 
225 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  36.25 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  42.44 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  41.01 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  41.21 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  36.52 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  42.26 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  42.46 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  41.24 
 
 
252 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  41.01 
 
 
245 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  41.01 
 
 
252 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1504  hypothetical protein  43.5 
 
 
352 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  41.01 
 
 
252 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  41.01 
 
 
252 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>