More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6133 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  100 
 
 		 473 aa  969    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  82.07 
 
 		 475 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  87.16 
 
 		 472 aa  791    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  83.15 
 
 		 475 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.08 
 
 		 475 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  81.86 
 
 		 475 aa  772    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.3 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  65.22 
 
 		 472 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.24 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1410  oxidoreductase, FAD-binding  64.24 
 
 		 468 aa  601  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1366  oxidoreductase, FAD-binding  63.8 
 
 		 465 aa  589  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.866723  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  61.1 
 
 		 469 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.15 
 
 		 492 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.15 
 
 		 470 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62.26 
 
 		 484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2807  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.71 
 
 		 470 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  61.39 
 
 		 468 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  59.82 
 
 		 465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  58.66 
 
 		 495 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  59.91 
 
 		 468 aa  560  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  58.15 
 
 		 476 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.46 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.52 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.6 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  56.66 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  54.26 
 
 		 471 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  54.68 
 
 		 471 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  55 
 
 		 469 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.22 
 
 		 469 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  54.39 
 
 		 472 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.43 
 
 		 488 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  55.46 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.78 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.46 
 
 		 485 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  55.01 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  55.01 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  55.01 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  54.35 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  54.82 
 
 		 472 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.57 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  55.01 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  55.68 
 
 		 452 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  55.01 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  55.01 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.57 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  55.01 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  53.8 
 
 		 473 aa  521  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  56.09 
 
 		 462 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.26 
 
 		 474 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.56 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.8 
 
 		 473 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.14 
 
 		 464 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 474 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  54.35 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  56.43 
 
 		 474 aa  511  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.52 
 
 		 470 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  52.29 
 
 		 474 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.64 
 
 		 477 aa  508  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.95 
 
 		 497 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  54.17 
 
 		 497 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  54.77 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  54.17 
 
 		 497 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.73 
 
 		 497 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.73 
 
 		 477 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.73 
 
 		 497 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.73 
 
 		 497 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  53.46 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  53.48 
 
 		 499 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.03 
 
 		 460 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  53.2 
 
 		 457 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.42 
 
 		 457 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.54 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.74 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  50.33 
 
 		 478 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.63 
 
 		 459 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.88 
 
 		 457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0144  FAD linked oxidase domain-containing protein  48 
 
 		 450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.37 
 
 		 482 aa  422  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  45 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  44.77 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  45 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  45 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  44.77 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.22 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  45 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.65 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.77 
 
 		 463 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  44.55 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  44.77 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  44.55 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  43.97 
 
 		 457 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55040  d-lactate dehydrogenase  43.56 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  43.05 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  41.78 
 
 		 447 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  40.87 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  42.86 
 
 		 565 aa  338  9e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2410  FAD linked oxidase-like  42.07 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  40.88 
 
 		 560 aa  317  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0540  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.299448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>