183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0016 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  81.54 
 
 
458 aa  739  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  82.2 
 
 
454 aa  751  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  83.52 
 
 
457 aa  760  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  78.68 
 
 
455 aa  705  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  931  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  59.02 
 
 
458 aa  471  1e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  40.09 
 
 
461 aa  283  5e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  34.67 
 
 
451 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  30.24 
 
 
446 aa  217  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  39.47 
 
 
451 aa  215  2e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  36.09 
 
 
449 aa  213  6e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  30.31 
 
 
446 aa  213  8e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  35.55 
 
 
462 aa  211  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  38.06 
 
 
460 aa  210  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  30.51 
 
 
446 aa  208  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  32.94 
 
 
450 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  32.47 
 
 
450 aa  202  1e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  35.39 
 
 
454 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  35.07 
 
 
461 aa  200  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  34.62 
 
 
470 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  33.08 
 
 
456 aa  199  1e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  32.54 
 
 
481 aa  197  2e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  31.28 
 
 
501 aa  196  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  32.87 
 
 
449 aa  196  8e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  35.41 
 
 
454 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  31.31 
 
 
468 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  37.82 
 
 
483 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  34.64 
 
 
457 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  34.44 
 
 
462 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  34.34 
 
 
459 aa  190  6e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  35.1 
 
 
454 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  34 
 
 
470 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  34.28 
 
 
463 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  34.28 
 
 
464 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  30.8 
 
 
455 aa  186  1e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  31.89 
 
 
453 aa  185  1e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  36.96 
 
 
481 aa  184  2e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  34.12 
 
 
494 aa  184  4e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  34.53 
 
 
482 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  34.68 
 
 
456 aa  181  3e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  37.57 
 
 
481 aa  181  3e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  30.95 
 
 
458 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  38.78 
 
 
468 aa  179  6e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  35.33 
 
 
454 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  35.01 
 
 
488 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  34.28 
 
 
476 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  33.65 
 
 
463 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  31.13 
 
 
449 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  29.27 
 
 
457 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
442 aa  165  2e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  41.22 
 
 
447 aa  164  4e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 
503 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  30.73 
 
 
458 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  32.17 
 
 
482 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  34.43 
 
 
471 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  33.49 
 
 
476 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  31.35 
 
 
447 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  35.5 
 
 
503 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  35.5 
 
 
503 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  34.33 
 
 
472 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  30.57 
 
 
504 aa  154  3e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 
460 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  29.3 
 
 
451 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  39.32 
 
 
468 aa  152  9e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  31.21 
 
 
450 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  31.83 
 
 
462 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.83 
 
 
461 aa  149  1e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  30.99 
 
 
443 aa  148  2e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  30.17 
 
 
474 aa  148  2e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  33.99 
 
 
359 aa  147  4e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  28.33 
 
 
460 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  32.63 
 
 
461 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  27.9 
 
 
469 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  32.38 
 
 
451 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  30.15 
 
 
453 aa  140  4e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  33.24 
 
 
456 aa  140  5e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  32.54 
 
 
461 aa  139  8e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  32.68 
 
 
453 aa  139  9e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  32.02 
 
 
462 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  28.98 
 
 
485 aa  137  3e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.55 
 
 
450 aa  137  3e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  27.23 
 
 
481 aa  137  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.82 
 
 
465 aa  137  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  33.67 
 
 
457 aa  135  1e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  30.13 
 
 
458 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  28.44 
 
 
449 aa  134  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  30.16 
 
 
467 aa  132  1e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  29.96 
 
 
500 aa  131  2e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  29.09 
 
 
490 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  30.47 
 
 
445 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  28.5 
 
 
441 aa  130  4e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.91 
 
 
458 aa  129  1e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  33.04 
 
 
482 aa  128  2e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  31.36 
 
 
450 aa  129  2e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  28.89 
 
 
441 aa  127  4e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  32.22 
 
 
453 aa  122  1e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  29.31 
 
 
441 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  28.57 
 
 
453 aa  120  5e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  25.5 
 
 
472 aa  118  2e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  30.17 
 
 
451 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>