225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7659 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  72.61 
 
 		 255 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4552  LamB/YcsF family protein  72.61 
 
 		 255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  63.78 
 
 		 256 aa  334  7.999999999999999e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  54.47 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  53.78 
 
 		 254 aa  254  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  51.82 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  51.82 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 		 261 aa  214  8e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  43.39 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  39.36 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  43.9 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  44.62 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  44.22 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0130  hypothetical protein  42.35 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  44.31 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  40.96 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  43.82 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  43.82 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  39.18 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  39.76 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  39.37 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  40.41 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  39.37 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  45.87 
 
 		 254 aa  197  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  43.19 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  43.19 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  43.19 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  40.4 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  41.9 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  40.89 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  43.19 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  46.15 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  39.24 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1880  hypothetical protein  42.8 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0893  hypothetical protein  42.8 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1179  hypothetical protein  42.8 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2156  hypothetical protein  42.8 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  40.89 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  37.85 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  42.15 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  40.96 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  41.53 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  40.16 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  41.39 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4577  hypothetical protein  42.97 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00594696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2435  hypothetical protein  41.06 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  41.2 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  37.25 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 		 273 aa  191  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  38.15 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  40.41 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  41 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  41.8 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  42 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  42.28 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  41.9 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  36 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  40.49 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  40.49 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  40.49 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  39.52 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  43.5 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  43.03 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 		 262 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  40.71 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  40.57 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  42.21 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  39.48 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  39.27 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  41.46 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  38.71 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  38.46 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0006  LamB/YcsF family protein  39.83 
 
 		 242 aa  185  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  41.8 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  41.87 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  41.8 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  40.73 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>