38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4365 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4365  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1284    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00793979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1898  hypothetical protein  49.6 
 
 		 575 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.487361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2708  hypothetical protein  51.68 
 
 		 595 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2023  hypothetical protein  51.67 
 
 		 602 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00080  hypothetical protein  50.67 
 
 		 568 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3181  hypothetical protein  46.15 
 
 		 580 aa  501  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.637491 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5961  hypothetical protein  32.47 
 
 		 602 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0164174 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0386  pseudouridine synthase, RluD  32.03 
 
 		 580 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.945597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37650  hypothetical protein  28.61 
 
 		 634 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.191863  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3212  hypothetical protein  28.57 
 
 		 634 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1670  hypothetical protein  30.08 
 
 		 605 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000354667  normal  0.0752572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37640  hypothetical protein  28.57 
 
 		 624 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.011725  normal  0.639199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39440  hypothetical protein  28.57 
 
 		 631 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3351  hypothetical protein  28.86 
 
 		 631 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2167  hypothetical protein  29.42 
 
 		 624 aa  171  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.0198055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3211  hypothetical protein  28.42 
 
 		 624 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1382  hypothetical protein  28.49 
 
 		 935 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686008  normal  0.478285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1293  hypothetical protein  47.4 
 
 		 183 aa  161  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.833643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1586  ribonuclease E and G  26.3 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1587  pseudouridine synthase, RluD  28.77 
 
 		 551 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.477601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3697  hypothetical protein  25.86 
 
 		 585 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2188  hypothetical protein  42.34 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5218  hypothetical protein  51.06 
 
 		 622 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0341555  hitchhiker  0.000592989 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2940  hypothetical protein  39.42 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1797  hypothetical protein  50 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4647  hypothetical protein  47.52 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000289312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4645  hypothetical protein  44.55 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000345965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2939  hypothetical protein  37.76 
 
 		 505 aa  76.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.582281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05639  hypothetical protein  47.42 
 
 		 628 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1798  hypothetical protein  43.93 
 
 		 506 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2187  hypothetical protein  38.66 
 
 		 515 aa  68.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1610  hypothetical protein  41.9 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3772  hypothetical protein  39.25 
 
 		 532 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0742715  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0604  hypothetical protein  31.82 
 
 		 386 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1446  hypothetical protein  60.53 
 
 		 678 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1661  hypothetical protein  27.41 
 
 		 676 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.773537  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1647  hypothetical protein  32.28 
 
 		 522 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0007  hypothetical protein  58.33 
 
 		 90 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>