More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1586 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  100 
 
 
342 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  83.73 
 
 
350 aa  555  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  74.32 
 
 
329 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  74.32 
 
 
329 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  74.24 
 
 
338 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  67.65 
 
 
352 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  70.62 
 
 
343 aa  444  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  70.5 
 
 
359 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  66.56 
 
 
329 aa  411  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  63.8 
 
 
329 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  63.5 
 
 
329 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  61.35 
 
 
327 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  63.19 
 
 
327 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  62.73 
 
 
329 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  62.88 
 
 
327 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1824  GTPase ObgE  65.05 
 
 
329 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.853156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03941  GTPase ObgE  65.64 
 
 
329 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  65.75 
 
 
327 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  52.07 
 
 
350 aa  312  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  52.79 
 
 
347 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  50.72 
 
 
345 aa  308  8e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  52.08 
 
 
405 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  51.36 
 
 
351 aa  305  6e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.76 
 
 
438 aa  305  8.000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  51.88 
 
 
373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  50.45 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  51.59 
 
 
373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  49.12 
 
 
427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  50.59 
 
 
391 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  49.14 
 
 
406 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.24 
 
 
370 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  50.88 
 
 
346 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  54.19 
 
 
348 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  48.38 
 
 
337 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50.45 
 
 
406 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  50.59 
 
 
406 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  51.04 
 
 
387 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  50.72 
 
 
397 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  49.41 
 
 
341 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  50.72 
 
 
372 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  54.24 
 
 
419 aa  300  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  51.38 
 
 
332 aa  298  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  49.41 
 
 
353 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  49.12 
 
 
341 aa  298  8e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  49.27 
 
 
392 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  48.8 
 
 
408 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  48.8 
 
 
407 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  48.8 
 
 
408 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  48.65 
 
 
407 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  48.1 
 
 
440 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  50.86 
 
 
372 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  51.35 
 
 
370 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  51.37 
 
 
370 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  50.86 
 
 
372 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  50.86 
 
 
372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  50.86 
 
 
372 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  50 
 
 
353 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  50.86 
 
 
372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  50.86 
 
 
372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  50.86 
 
 
372 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  48.8 
 
 
407 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  48.8 
 
 
408 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.38 
 
 
342 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  49.39 
 
 
408 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  51.84 
 
 
343 aa  295  9e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  49.28 
 
 
346 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.58 
 
 
356 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  48.12 
 
 
395 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  48.97 
 
 
353 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  50 
 
 
326 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  50.75 
 
 
338 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  50.59 
 
 
364 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.56 
 
 
342 aa  293  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.92 
 
 
425 aa  292  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  51.04 
 
 
422 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  50.59 
 
 
364 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.45 
 
 
338 aa  292  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  50.15 
 
 
397 aa  292  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  50.45 
 
 
365 aa  291  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  51.82 
 
 
379 aa  291  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  50.15 
 
 
391 aa  291  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  48.68 
 
 
345 aa  291  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  47.38 
 
 
357 aa  291  9e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  48.5 
 
 
339 aa  291  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  47.98 
 
 
357 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  50.15 
 
 
361 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  51.82 
 
 
357 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  48.68 
 
 
423 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  50.89 
 
 
366 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  50 
 
 
397 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  45.91 
 
 
394 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  48.97 
 
 
358 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  49.71 
 
 
364 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  55.21 
 
 
349 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.65 
 
 
344 aa  289  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.65 
 
 
344 aa  289  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  48.82 
 
 
343 aa  289  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  51.01 
 
 
362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  49.42 
 
 
390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>