More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0513 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
351 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  84.33 
 
 
350 aa  601  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  74.36 
 
 
328 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  73.22 
 
 
341 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  73.22 
 
 
341 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  69.69 
 
 
351 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  72.65 
 
 
349 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  68.66 
 
 
325 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  51.54 
 
 
304 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  48.21 
 
 
315 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  47.13 
 
 
304 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  47.56 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  48.71 
 
 
295 aa  282  7.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  50.17 
 
 
318 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  46.89 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  46.56 
 
 
309 aa  271  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  48.69 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  49.02 
 
 
311 aa  268  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  47.54 
 
 
309 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.68 
 
 
283 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  40.38 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  34.04 
 
 
472 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  39.32 
 
 
284 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.26 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  36.42 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.94 
 
 
446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  35.24 
 
 
278 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  33.24 
 
 
444 aa  162  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.94 
 
 
438 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  34.6 
 
 
283 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  33.43 
 
 
444 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.43 
 
 
444 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.66 
 
 
373 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  32.85 
 
 
442 aa  156  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  31.62 
 
 
463 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  31.88 
 
 
465 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1199  cytochrome c assembly protein  30.95 
 
 
385 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  66.67 
 
 
282 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  66.67 
 
 
282 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  66.67 
 
 
282 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  63.37 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1636  resC protein  28.76 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0783645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1600  resC protein  28.57 
 
 
385 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1357  cytochrome c biogenesis protein  28.57 
 
 
385 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3815  resC protein  28.76 
 
 
385 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000474792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  30.35 
 
 
473 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  60.58 
 
 
271 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  64.65 
 
 
284 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0401  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.88 
 
 
397 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  61.54 
 
 
271 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  59.62 
 
 
271 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  58.04 
 
 
271 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  64.29 
 
 
285 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  60.19 
 
 
278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  34.02 
 
 
396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  60.58 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  57.66 
 
 
271 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.35 
 
 
346 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  31.37 
 
 
391 aa  135  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  30.25 
 
 
378 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  55.77 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.8 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  40.7 
 
 
276 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  33.45 
 
 
397 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.12 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  58.25 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.75 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  51.52 
 
 
339 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  53.57 
 
 
272 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  56.12 
 
 
283 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  29.63 
 
 
328 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  29.94 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  29.94 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  51.82 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  29.94 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  29.78 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.69 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  51.82 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  57.58 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  57.58 
 
 
352 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0824  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.96 
 
 
357 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.341691  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  42.86 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  29.58 
 
 
324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.48 
 
 
323 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  53.33 
 
 
405 aa  119  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  51.89 
 
 
341 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  51.46 
 
 
330 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  42.21 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.21 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  42.21 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  42.21 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  42.21 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  42.21 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  42.11 
 
 
401 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  42.76 
 
 
379 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  42.21 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  42.21 
 
 
408 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  42.21 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.21 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  42.21 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>