More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2255 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
485 aa  991    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
482 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 
485 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 
488 aa  561  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 
486 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 
490 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
485 aa  511  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
491 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
491 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
485 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
485 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
485 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
485 aa  500  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
485 aa  500  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
485 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
485 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
488 aa  498  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
491 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
491 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 
481 aa  495  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
490 aa  495  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 
477 aa  494  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 
478 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
485 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
490 aa  482  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
479 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
484 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
484 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
501 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
491 aa  455  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
469 aa  455  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
480 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
469 aa  443  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
469 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  43.91 
 
 
495 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
495 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
473 aa  435  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
494 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  43.88 
 
 
546 aa  419  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
504 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
493 aa  411  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
488 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  40.57 
 
 
518 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
500 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
465 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
467 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
468 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
492 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
467 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
466 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
492 aa  391  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
498 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
469 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
481 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
492 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
483 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
484 aa  388  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
491 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
482 aa  384  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
483 aa  384  1e-105  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
467 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
504 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
467 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 
484 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
483 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
498 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
466 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
463 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
464 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
467 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
483 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
464 aa  375  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
466 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
501 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
481 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
481 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
494 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
502 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
464 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
535 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
484 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
471 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
502 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
466 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
481 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
465 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
482 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
480 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
881 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
466 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1080  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
445 aa  364  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
504 aa  364  2e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
498 aa  364  2e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
472 aa  363  3e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>