More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4161 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  100 
 
 
318 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  87.74 
 
 
318 aa  580  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  67.53 
 
 
332 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  67.86 
 
 
319 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  65.29 
 
 
333 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  68.52 
 
 
310 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  66.01 
 
 
333 aa  423  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  64.71 
 
 
313 aa  421  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  64.13 
 
 
340 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  65.03 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  62.99 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  63.75 
 
 
330 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  63.84 
 
 
310 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  66.78 
 
 
309 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  62.54 
 
 
359 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  62.74 
 
 
348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  64.13 
 
 
325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  62.01 
 
 
353 aa  401  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  66.01 
 
 
344 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  65.26 
 
 
317 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  61.61 
 
 
331 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  62.38 
 
 
333 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  62.38 
 
 
333 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  62.38 
 
 
333 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  62.21 
 
 
310 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  61.98 
 
 
336 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  63.82 
 
 
348 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  57.23 
 
 
313 aa  376  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  60.06 
 
 
335 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  60.33 
 
 
330 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  61.79 
 
 
325 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  58.33 
 
 
330 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  60.19 
 
 
329 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  58.77 
 
 
331 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  59.48 
 
 
318 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  62.25 
 
 
327 aa  363  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  60.98 
 
 
327 aa  362  4e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  57.74 
 
 
361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  58.52 
 
 
329 aa  354  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  58.92 
 
 
317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  58.44 
 
 
362 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  59.87 
 
 
325 aa  344  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  54.97 
 
 
334 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  56.86 
 
 
332 aa  341  8e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  54.66 
 
 
311 aa  335  5.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  53.9 
 
 
311 aa  328  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  53.72 
 
 
314 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  54.98 
 
 
320 aa  326  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  53.72 
 
 
314 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  52.9 
 
 
311 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  53.95 
 
 
334 aa  322  5e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  49.1 
 
 
339 aa  322  6e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  56.25 
 
 
325 aa  322  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.14 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  52.27 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  52.15 
 
 
321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  53.8 
 
 
319 aa  318  7e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  53.62 
 
 
321 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
311 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  50.62 
 
 
361 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  51.3 
 
 
311 aa  316  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  49.5 
 
 
314 aa  315  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  51.46 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  53.62 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  51.82 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  48.77 
 
 
345 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  51.99 
 
 
320 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  53.07 
 
 
314 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  51.97 
 
 
321 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
314 aa  309  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  51.64 
 
 
317 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  51.64 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  50.5 
 
 
309 aa  305  6e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  50 
 
 
325 aa  305  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
460 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  51.15 
 
 
335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  51.97 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  51.92 
 
 
320 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  49.35 
 
 
331 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
324 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  50.97 
 
 
317 aa  299  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  48.57 
 
 
314 aa  299  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  48.2 
 
 
323 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  48.2 
 
 
323 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  49.37 
 
 
316 aa  298  6e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3139  thioredoxin-disulfide reductase  50.32 
 
 
338 aa  298  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  51.3 
 
 
314 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
313 aa  297  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  47.6 
 
 
323 aa  297  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
312 aa  296  2e-79  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  49.37 
 
 
316 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  51.43 
 
 
320 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  49.36 
 
 
332 aa  296  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  52.6 
 
 
316 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  47.5 
 
 
322 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  47.5 
 
 
322 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  51.3 
 
 
315 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  49.19 
 
 
324 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0429  thioredoxin reductase  48.58 
 
 
340 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.749384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>