More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1826 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  100 
 
 
336 aa  635  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  53.33 
 
 
348 aa  275  8e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  49.16 
 
 
324 aa  261  9e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  45.37 
 
 
331 aa  256  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  45.95 
 
 
341 aa  249  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  49.16 
 
 
322 aa  248  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  46.01 
 
 
311 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.52632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  46.18 
 
 
311 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  46.18 
 
 
311 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  46.18 
 
 
311 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  45.62 
 
 
327 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  45.86 
 
 
311 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  45.86 
 
 
311 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
311 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  48.16 
 
 
330 aa  245  7e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  48.16 
 
 
330 aa  245  7e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
311 aa  245  7e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.30424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  48.16 
 
 
330 aa  245  7e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  48.48 
 
 
327 aa  245  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  45.54 
 
 
311 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  46.6 
 
 
334 aa  245  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  45.54 
 
 
311 aa  244  1e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  45.54 
 
 
311 aa  244  1e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  46.43 
 
 
334 aa  243  4e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  46.43 
 
 
334 aa  243  4e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  49.29 
 
 
323 aa  242  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  46.82 
 
 
311 aa  240  3e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  46.4 
 
 
309 aa  239  7e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.15 
 
 
310 aa  236  5e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  44.82 
 
 
310 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  48.48 
 
 
324 aa  235  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  47.46 
 
 
334 aa  234  1e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  45.08 
 
 
835 aa  234  1e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  47.46 
 
 
334 aa  234  1e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  46.34 
 
 
334 aa  234  1e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  47.78 
 
 
336 aa  233  2e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  46.78 
 
 
314 aa  234  2e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  41.04 
 
 
342 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  45.14 
 
 
342 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  45.49 
 
 
334 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  46.46 
 
 
322 aa  232  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  44.33 
 
 
312 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  45.39 
 
 
331 aa  229  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5600  ribose transport system permease protein RbsC  47.14 
 
 
324 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 
310 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  45.28 
 
 
320 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  46.85 
 
 
322 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  43.84 
 
 
330 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  6.2023e-05 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  46.13 
 
 
322 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
330 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  43.84 
 
 
330 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  44.1 
 
 
316 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.22 
 
 
350 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  46.8 
 
 
322 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  44.97 
 
 
340 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  46.13 
 
 
321 aa  223  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  46.13 
 
 
321 aa  223  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  46.13 
 
 
321 aa  223  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  46.13 
 
 
321 aa  223  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  46.13 
 
 
321 aa  223  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  46.13 
 
 
321 aa  221  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  46.46 
 
 
321 aa  222  9e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  46.46 
 
 
321 aa  222  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  46.46 
 
 
321 aa  222  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  46.46 
 
 
321 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  46.46 
 
 
321 aa  222  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  46.46 
 
 
321 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  46.46 
 
 
321 aa  222  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  46.46 
 
 
321 aa  222  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  44.09 
 
 
322 aa  221  1e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  44.95 
 
 
345 aa  221  1e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  42.91 
 
 
320 aa  221  2e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.13624e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  44.65 
 
 
345 aa  221  2e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  44.97 
 
 
338 aa  220  2e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  46.46 
 
 
321 aa  220  2e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  7.74907e-07 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  44.65 
 
 
345 aa  221  2e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  40.86 
 
 
346 aa  221  2e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  44.12 
 
 
338 aa  220  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  43 
 
 
315 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  42.66 
 
 
306 aa  220  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  45.26 
 
 
345 aa  219  4e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  47.18 
 
 
339 aa  219  4e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  42.37 
 
 
325 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  41.69 
 
 
342 aa  218  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  41.3 
 
 
309 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  46.3 
 
 
344 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  42.07 
 
 
346 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
310 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  46.3 
 
 
344 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  45.26 
 
 
345 aa  216  3e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  43.75 
 
 
335 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  42.9 
 
 
337 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  44.95 
 
 
345 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  42.86 
 
 
313 aa  216  6e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  42.95 
 
 
314 aa  216  6e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  44.65 
 
 
345 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  42.11 
 
 
322 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  45.57 
 
 
318 aa  214  2e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  42.52 
 
 
328 aa  214  2e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  41.35 
 
 
383 aa  214  2e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>