More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1513 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1513  amino acid carrier protein  100 
 
 
459 aa  914    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000793212  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  42.09 
 
 
457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  39.73 
 
 
489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  38.32 
 
 
494 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  38.33 
 
 
477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  39.73 
 
 
483 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  38.32 
 
 
477 aa  318  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  38.75 
 
 
480 aa  316  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  39.64 
 
 
485 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  38.44 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  38.67 
 
 
493 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  39.6 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  35.94 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  38.41 
 
 
498 aa  302  6.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  39.41 
 
 
492 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  38.98 
 
 
480 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  38.36 
 
 
456 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3242  amino acid carrier protein  38.98 
 
 
480 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  36.94 
 
 
502 aa  299  7e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1148  amino acid carrier protein  38.75 
 
 
480 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209129  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2964  amino acid carrier protein  38.44 
 
 
488 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.302472  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3144  amino acid carrier protein  38.22 
 
 
488 aa  296  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0262714  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1052  amino acid carrier protein  38.22 
 
 
481 aa  296  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  38.01 
 
 
480 aa  296  7e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  37.69 
 
 
481 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  38.72 
 
 
471 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3541  sodium:alanine symporter family protein  38 
 
 
488 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  37.14 
 
 
451 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  37.58 
 
 
466 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  37.47 
 
 
480 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  37.33 
 
 
480 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2575  amino acid carrier protein  38.46 
 
 
471 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  38.72 
 
 
471 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  35.49 
 
 
483 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  35.49 
 
 
483 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  36.74 
 
 
493 aa  292  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  37.15 
 
 
479 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  37.14 
 
 
466 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  37.15 
 
 
479 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  37.15 
 
 
479 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  37.15 
 
 
479 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0569  amino acid carrier protein  37.81 
 
 
476 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.352189  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  37.15 
 
 
479 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  37.16 
 
 
496 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  36.16 
 
 
480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  37.61 
 
 
480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  36.93 
 
 
479 aa  289  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  36.93 
 
 
479 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  37 
 
 
469 aa  288  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1047  amino acid carrier protein  38.98 
 
 
480 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  38 
 
 
474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  36.94 
 
 
504 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  37.16 
 
 
504 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0006  amino-acid carrier protein AlsT  35.45 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  35.45 
 
 
476 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557087  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  36.94 
 
 
497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0617  amino acid carrier protein  36.17 
 
 
495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2730  amino acid carrier protein  38.1 
 
 
504 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000165436  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  35.45 
 
 
485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  35.29 
 
 
486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  35.29 
 
 
486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  34.93 
 
 
485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0006  amino-acid carrier protein AlsT  35.23 
 
 
485 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0332289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  36.6 
 
 
476 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  35.23 
 
 
485 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  35.59 
 
 
484 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  36.6 
 
 
476 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  36.82 
 
 
476 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  36.73 
 
 
494 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1259  amino acid carrier family protein  40.27 
 
 
474 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000459573  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3063  sodium:alanine symporter family protein  37.15 
 
 
495 aa  282  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  36.53 
 
 
478 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  37.42 
 
 
458 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  35.82 
 
 
487 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  36.04 
 
 
486 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  36.38 
 
 
476 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0411  amino acid carrier protein  37.23 
 
 
493 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1842  amino acid carrier protein  36.38 
 
 
468 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  36.38 
 
 
476 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  35.82 
 
 
486 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  36.26 
 
 
503 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1496  amino acid carrier protein  36.31 
 
 
495 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0539  amino acid carrier protein  36.16 
 
 
480 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1431  amino acid carrier protein  36.31 
 
 
495 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  35.82 
 
 
487 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  36.04 
 
 
503 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  35.82 
 
 
486 aa  279  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  36.04 
 
 
503 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  36.04 
 
 
503 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  35.82 
 
 
487 aa  279  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  36.04 
 
 
503 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  36.04 
 
 
503 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  36.04 
 
 
503 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0496  amino acid carrier protein  35.94 
 
 
480 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  35.73 
 
 
476 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  33.19 
 
 
475 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  36.49 
 
 
497 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  36.49 
 
 
497 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  35.73 
 
 
476 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  35.6 
 
 
486 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>