More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1842 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2575  amino acid carrier protein  69.02 
 
 		 471 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02218  putative amino acid permease  66.88 
 
 		 468 aa  638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00221678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1842  amino acid carrier protein  100 
 
 		 468 aa  949    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  50.53 
 
 		 477 aa  481  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  49.37 
 
 		 494 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  49.68 
 
 		 477 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  51.39 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  51.07 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  50.96 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  49.26 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  47.99 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  47.67 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6060  amino acid carrier protein  49.26 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5996  amino acid carrier protein  49.26 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  45.89 
 
 		 502 aa  438  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3541  sodium:alanine symporter family protein  47.78 
 
 		 488 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  46.93 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2964  amino acid carrier protein  47.99 
 
 		 488 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.302472  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3144  amino acid carrier protein  47.99 
 
 		 488 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0262714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1052  amino acid carrier protein  47.15 
 
 		 481 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  49.26 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  48.39 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  46.93 
 
 		 480 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3242  amino acid carrier protein  46.93 
 
 		 480 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1148  amino acid carrier protein  46.72 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209129  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1241  amino acid carrier protein  48.2 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.912525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  45.6 
 
 		 498 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  46.15 
 
 		 489 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0422  amino acid carrier family protein  46.48 
 
 		 477 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.797168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  45.18 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3565  amino acid carrier protein  49.69 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  44.69 
 
 		 502 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  45.06 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  45.34 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0006  amino-acid carrier protein AlsT  44.97 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0332289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1047  amino acid carrier protein  46.51 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370244  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  44.97 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  47.55 
 
 		 483 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0483  amino acid carrier family protein  45.84 
 
 		 477 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.489215  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2730  amino acid carrier protein  45.88 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000165436  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0006  amino-acid carrier protein AlsT  44.75 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  46.48 
 
 		 485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  47.78 
 
 		 492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  42.68 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  42.89 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  43.1 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  42.89 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  43.62 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  43.62 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0569  amino acid carrier protein  45.55 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.352189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  44.88 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  44.01 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  42.46 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  42.46 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  43.83 
 
 		 457 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  43.1 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  42.25 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  42.46 
 
 		 476 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  44.01 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  42.42 
 
 		 479 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  42.42 
 
 		 479 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  42.2 
 
 		 479 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  42.2 
 
 		 479 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  42.2 
 
 		 479 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  41.85 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0008  amino acid carrier protein  45.15 
 
 		 476 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.248678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  42.2 
 
 		 479 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  41.15 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  42.03 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00007  predicted transporter  44.93 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3648  amino acid carrier protein  44.93 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0006  amino acid carrier protein  45.15 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  41.63 
 
 		 480 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  41.98 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00007  hypothetical protein  44.93 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3589  amino acid carrier protein  44.71 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  44.05 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  43.4 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  43.62 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0007  amino acid carrier protein  44.93 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.665719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  42.98 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  42.39 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  44.39 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  43.4 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0008  amino acid carrier protein  44.93 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.876133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  43.19 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  42.98 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0007  amino acid carrier protein  44.49 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  43.01 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  41.96 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  42.98 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  41.88 
 
 		 480 aa  359  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  42.42 
 
 		 486 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  42.42 
 
 		 486 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  42.28 
 
 		 503 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  42.28 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  42.28 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  42.28 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  42.28 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  42.28 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>