More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0006 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00007  predicted transporter  76.26 
 
 		 476 aa  716    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3589  amino acid carrier protein  76.26 
 
 		 476 aa  715    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0008  amino acid carrier protein  76.68 
 
 		 476 aa  716    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.248678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00007  hypothetical protein  76.26 
 
 		 476 aa  716    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  98.97 
 
 		 485 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0006  amino-acid carrier protein AlsT  98.97 
 
 		 485 aa  966    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0006  amino acid carrier protein  76.47 
 
 		 476 aa  716    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0008  amino acid carrier protein  76.47 
 
 		 476 aa  716    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.876133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3648  amino acid carrier protein  76.26 
 
 		 476 aa  716    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0007  amino acid carrier protein  76.26 
 
 		 476 aa  714    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.665719  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0006  amino-acid carrier protein AlsT  100 
 
 		 485 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0332289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  100 
 
 		 485 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  99.58 
 
 		 476 aa  952    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0007  amino acid carrier protein  76.05 
 
 		 476 aa  711    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0569  amino acid carrier protein  73.95 
 
 		 476 aa  692    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.352189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  52.09 
 
 		 494 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  52.54 
 
 		 477 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  52.44 
 
 		 476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  52.51 
 
 		 477 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  55.08 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  53.47 
 
 		 471 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  53.26 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  48.64 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  46.43 
 
 		 480 aa  465  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3242  amino acid carrier protein  48.84 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1148  amino acid carrier protein  49.05 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209129  normal  0.592046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  47.35 
 
 		 480 aa  458  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  48.84 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2964  amino acid carrier protein  49.06 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.302472  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1052  amino acid carrier protein  48.31 
 
 		 481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  47.69 
 
 		 489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3541  sodium:alanine symporter family protein  48.85 
 
 		 488 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  48.41 
 
 		 470 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3144  amino acid carrier protein  48.43 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0262714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1047  amino acid carrier protein  49.05 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370244  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2730  amino acid carrier protein  48.22 
 
 		 504 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000165436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2575  amino acid carrier protein  47.18 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  48.49 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  46.6 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  47.71 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3565  amino acid carrier protein  50.83 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0685949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  46.41 
 
 		 502 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  47.2 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1241  amino acid carrier protein  47.35 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.912525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  45.15 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  47.1 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  46.07 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  46.34 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  46.34 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  46.34 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  44.4 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  46.35 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  46.35 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  45.34 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  43.96 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  44.58 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  44.89 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  46.35 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  46.35 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  46.35 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  44.58 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  45.91 
 
 		 503 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02218  putative amino acid permease  44.75 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00221678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  45.73 
 
 		 458 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  45.44 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  44.17 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  46.35 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  44.44 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  46.35 
 
 		 503 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  45.26 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  43.91 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  45.32 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1842  amino acid carrier protein  44.75 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  44.61 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  43.74 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  42.47 
 
 		 480 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  43.96 
 
 		 476 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  43.74 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  45.47 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  44.61 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  44.23 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  43.2 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5996  amino acid carrier protein  45.22 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  43.97 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  43.56 
 
 		 483 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6060  amino acid carrier protein  45.22 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  44.76 
 
 		 466 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  43.51 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  42.89 
 
 		 479 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  43.13 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  42.92 
 
 		 479 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  42.68 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  42.89 
 
 		 479 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  43.97 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  42.29 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  43.36 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  43.36 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  42.92 
 
 		 479 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  43.53 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0422  amino acid carrier family protein  43.52 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.797168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>