More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0496 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0496  amino acid carrier protein  100 
 
 		 480 aa  963    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5500  sodium/alanine transporter  75.58 
 
 		 483 aa  722    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0530  amino acid carrier protein  99.58 
 
 		 480 aa  960    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2989  putative AGCS sodium/alanine/glycine symporter  89.15 
 
 		 481 aa  821    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5052  Sodium:alanine symporter  76.01 
 
 		 483 aa  722    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.649994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5626  Sodium:alanine symporter  91.27 
 
 		 481 aa  868    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28273  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0539  amino acid carrier protein  97.71 
 
 		 480 aa  930    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0551  amino acid carrier protein  95.21 
 
 		 480 aa  912    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35460  putative AGCS sodium/alanine/glycine symporter  89.91 
 
 		 481 aa  820    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.0108121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0135  amino acid carrier protein  62.5 
 
 		 480 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2651  amino acid carrier protein  55.08 
 
 		 475 aa  522  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00749872  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  46.51 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  47.64 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  47.05 
 
 		 494 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  47.56 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  46.7 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  47.57 
 
 		 498 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2699  amino acid carrier protein  45.67 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  47.63 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  43.87 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  47.2 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2733  amino acid carrier protein  43.75 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1769  amino acid carrier protein  43.75 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3713  amino acid carrier protein  43.75 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  48.48 
 
 		 502 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3012  amino acid carrier protein  43.24 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3218  amino acid carrier protein  43.75 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  43.72 
 
 		 478 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3744  sodium:alanine symporter family protein  43.66 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  44.37 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2785  amino acid carrier protein  43.75 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  42.98 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3687  sodium:alanine symporter family protein  43.75 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  42.27 
 
 		 495 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  42.53 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  42.68 
 
 		 504 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  42.53 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  44.12 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  45.28 
 
 		 480 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  43.1 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0687  amino acid carrier protein  45.97 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.130364  hitchhiker  0.00619248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  43.1 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  43.1 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  43.1 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  43.52 
 
 		 476 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  43.9 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  45.13 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  43.31 
 
 		 476 aa  395  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1283  amino acid carrier protein  44.89 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100083  normal  0.240297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  44 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  43.19 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  42.62 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  42.83 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  42.83 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  42.95 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  44.01 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  43.04 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  42.68 
 
 		 476 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  43.01 
 
 		 458 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  45.63 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  43.4 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2897  amino acid carrier protein  44.1 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  42.73 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  42.74 
 
 		 479 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  42.53 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  42.74 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  42.89 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  43.1 
 
 		 479 aa  385  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  42.74 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  43.74 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3608  amino acid carrier protein  45.92 
 
 		 475 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221851  normal  0.096261 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  42.89 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  42.95 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  42.32 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  42.53 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  42.32 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  43.88 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  43.71 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  42.32 
 
 		 477 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  42.05 
 
 		 488 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  42.92 
 
 		 493 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  44.14 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  42.27 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.557087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  44.35 
 
 		 486 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  44.35 
 
 		 486 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3541  sodium:alanine symporter family protein  44.91 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0006  amino-acid carrier protein AlsT  42 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  43.92 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  44.35 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  43.92 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  44.35 
 
 		 474 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  43.92 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2964  amino acid carrier protein  43.79 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.302472  normal  0.844283 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0006  amino-acid carrier protein AlsT  42.06 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0332289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  42.06 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1241  amino acid carrier protein  46.79 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.912525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1114  amino acid carrier protein  45.13 
 
 		 480 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000596574  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0006  amino-acid carrier protein AlsT  42.06 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2730  amino acid carrier protein  44.21 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000165436  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3144  amino acid carrier protein  43.38 
 
 		 488 aa  363  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0262714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>